62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1988 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1988  transglycosylase-associated protein  100 
 
 
79 aa  138  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.928213  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  53.16 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1208  transglycosylase-associated protein  74.68 
 
 
79 aa  84.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000243492  normal  0.0290476 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  59.49 
 
 
80 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  48.1 
 
 
79 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  50.63 
 
 
80 aa  77.8  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  53.16 
 
 
80 aa  77  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  53.25 
 
 
83 aa  75.5  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  55.84 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0730  Transglycosylase-associated protein  86.08 
 
 
79 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  46.84 
 
 
84 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
78 aa  71.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  55.13 
 
 
84 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  53.85 
 
 
83 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  55.13 
 
 
84 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  55.13 
 
 
84 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  50.63 
 
 
84 aa  68.2  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  49.37 
 
 
84 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  57.33 
 
 
84 aa  67  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  56 
 
 
84 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  50 
 
 
84 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  50 
 
 
84 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1911  transglycosylase-associated protein  48 
 
 
84 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233889  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6259  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196091  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3017  hypothetical protein  55.22 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3461  transglycosylase-associated protein  45.33 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1472  Transglycosylase-associated protein  53.23 
 
 
86 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434508  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4121  transglycosylase-associated protein  51.28 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000759893  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  47.44 
 
 
323 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2221  transglycosylase-associated protein  52.24 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.024328  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0149  hypothetical protein  47.44 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1601  transglycosylase associated protein family  47.44 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2627  hypothetical protein  47.44 
 
 
83 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2995  hypothetical protein  47.44 
 
 
83 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.401136  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2932  hypothetical protein  47.44 
 
 
83 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235775  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0997  hypothetical protein  48 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0860  transglycosylase-associated protein  56.67 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  53.45 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0805  transglycosylase-associated protein  47.5 
 
 
86 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0123  transglycosylase-associated protein  41.1 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1802  hypothetical protein  43.59 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.020628  hitchhiker  0.0021209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1609  conserved hypothetical conserved membrane protein  43.59 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  40.28 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  38.96 
 
 
85 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  38.96 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4137  Transglycosylase-associated protein  45.57 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0915055  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  38.46 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  42.47 
 
 
83 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  38.46 
 
 
84 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3895  transglycosylase-associated protein  38.89 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.720352  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0493  transglycosylase-associated protein  48.48 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  36.11 
 
 
96 aa  42.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0212  Transglycosylase-associated protein  44 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3814  transglycosylase-associated protein  44 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.781187  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  43.9 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  38.96 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  40.54 
 
 
84 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  38.1 
 
 
88 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  43.28 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>