47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2013 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 84 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1818  Transglycosylase-associated protein  88.1 
 
 		 84 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0629036  decreased coverage  0.000804955 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3340  hypothetical protein  59.04 
 
 		 83 aa  93.6  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679831  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  59.52 
 
 		 83 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  56.25 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  53.57 
 
 		 82 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  53.57 
 
 		 83 aa  83.6  8e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0789  Transglycosylase-associated protein  68.18 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4744  Transglycosylase-associated protein  63.64 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4169  transglycosylase-associated protein  53.73 
 
 		 82 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  51.85 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0493  transglycosylase-associated protein  56.06 
 
 		 83 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  49.38 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2654  transglycosylase-associated protein  56.72 
 
 		 83 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.299446  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2122  hypothetical protein  47.5 
 
 		 82 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2513  transglycosylase-associated protein  43.04 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.855723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0350  transglycosylase-associated protein  50.63 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.522608 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  45.57 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0964  hypothetical protein  55 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  45.45 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  44.16 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3895  transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.720352  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  43.04 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  43.04 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  37.97 
 
 		 103 aa  52.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  43.55 
 
 		 84 aa  51.6  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  39.53 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  41.18 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  39.19 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  39.19 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  39.19 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  39.19 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  37.84 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3529  transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  39.24 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  39.19 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  40.54 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  37.5 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  36.49 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3029  transglycosylase-associated protein  32.94 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6259  hypothetical protein  42.42 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  36.76 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  38.16 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  31.82 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3461  transglycosylase-associated protein  37.84 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>