60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4744 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4744  Transglycosylase-associated protein  100 
 
 
85 aa  157  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0789  Transglycosylase-associated protein  89.06 
 
 
85 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  67.86 
 
 
84 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3340  hypothetical protein  67.07 
 
 
83 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679831  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  65.06 
 
 
83 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  56.63 
 
 
83 aa  94.4  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1818  Transglycosylase-associated protein  72.62 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0629036  decreased coverage  0.000804955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  58.75 
 
 
82 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  54.76 
 
 
82 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4169  transglycosylase-associated protein  62.12 
 
 
82 aa  84  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0493  transglycosylase-associated protein  64.62 
 
 
83 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2654  transglycosylase-associated protein  62.12 
 
 
83 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.299446  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  54.43 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0964  hypothetical protein  63.16 
 
 
83 aa  72.8  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2513  transglycosylase-associated protein  48.1 
 
 
83 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.855723  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  47.56 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0350  transglycosylase-associated protein  58.23 
 
 
83 aa  67.8  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.522608 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2122  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  41.25 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  43.06 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3895  transglycosylase-associated protein  39.02 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.720352  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  36.9 
 
 
103 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  43.68 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  43.68 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  41.86 
 
 
101 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  43.18 
 
 
90 aa  53.9  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  42.5 
 
 
84 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  45.33 
 
 
83 aa  53.9  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  42.5 
 
 
84 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  42.22 
 
 
88 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  40.96 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 
88 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  40 
 
 
84 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  42.11 
 
 
84 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  42.11 
 
 
84 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  42.11 
 
 
84 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  38.16 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0860  transglycosylase-associated protein  47.37 
 
 
85 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  39.73 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  42.11 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  43.24 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  41.33 
 
 
83 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  34.07 
 
 
323 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  34.21 
 
 
79 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4838  hypothetical protein  41.3 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  40 
 
 
88 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3029  transglycosylase-associated protein  29.73 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  39.47 
 
 
83 aa  43.5  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3461  transglycosylase-associated protein  41.33 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1911  transglycosylase-associated protein  41.33 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233889  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  37.93 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  42.67 
 
 
78 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  39.19 
 
 
84 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2251  transglycosylase-associated protein  36.05 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0500758  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  36 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  37.33 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 
89 aa  40.4  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  37.18 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  30.77 
 
 
83 aa  40.4  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>