20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3029 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3029  transglycosylase-associated protein  100 
 
 
87 aa  160  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3895  transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.720352  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  38.67 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0860  transglycosylase-associated protein  45.31 
 
 
85 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  33.72 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  30.67 
 
 
83 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  45.07 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  28.38 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  39.73 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  40.3 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  32.94 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  36.14 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  38.36 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3529  transglycosylase-associated protein  32.93 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  35.62 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  32.47 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  29.07 
 
 
89 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  34.12 
 
 
84 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  34.12 
 
 
84 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  34.12 
 
 
84 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>