47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1610 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  100 
 
 
82 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  92.68 
 
 
82 aa  147  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2122  hypothetical protein  59.76 
 
 
82 aa  91.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  56.25 
 
 
84 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1818  Transglycosylase-associated protein  60 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0629036  decreased coverage  0.000804955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  53.66 
 
 
83 aa  77.4  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3340  hypothetical protein  51.28 
 
 
83 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679831  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  49.38 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2513  transglycosylase-associated protein  50.62 
 
 
83 aa  72  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.855723  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  44.05 
 
 
83 aa  67.8  0.00000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0789  Transglycosylase-associated protein  57.81 
 
 
85 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4169  transglycosylase-associated protein  50.75 
 
 
82 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4744  Transglycosylase-associated protein  53.12 
 
 
85 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  48.1 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2654  transglycosylase-associated protein  46.27 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.299446  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  42.86 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  46.25 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  41.56 
 
 
84 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  40.96 
 
 
84 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  40.96 
 
 
84 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0493  transglycosylase-associated protein  44.78 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0964  hypothetical protein  49.15 
 
 
83 aa  54.3  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  41.25 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  43.02 
 
 
90 aa  53.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  38.82 
 
 
101 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  44.05 
 
 
88 aa  50.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0350  transglycosylase-associated protein  49.38 
 
 
83 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.522608 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  35.44 
 
 
323 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  41.38 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  39.19 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  42.67 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  37.5 
 
 
80 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  36.49 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  36.49 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  36.49 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6259  hypothetical protein  39.39 
 
 
81 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196091  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  36.49 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  34.72 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3029  transglycosylase-associated protein  39.73 
 
 
87 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  39.19 
 
 
80 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  33.33 
 
 
84 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  41.56 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3895  transglycosylase-associated protein  29.63 
 
 
92 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.720352  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  31.58 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4838  hypothetical protein  41.07 
 
 
87 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  37.97 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>