99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4749 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  100 
 
 
82 aa  147  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  67.05 
 
 
88 aa  103  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  65.12 
 
 
90 aa  94.7  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  61.18 
 
 
88 aa  89.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  57.83 
 
 
83 aa  82  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  57.83 
 
 
83 aa  81.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  57.14 
 
 
85 aa  80.1  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  61.36 
 
 
88 aa  79.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3901  transglycosylase-associated protein  53.57 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4346  transglycosylase-associated protein  41.3 
 
 
92 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0134878 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  51.85 
 
 
80 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  46.99 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1980  transglycosylase-associated protein  45.88 
 
 
82 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2694  transglycosylase-associated protein  44.3 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.975215  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  48.78 
 
 
84 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  48 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  47.56 
 
 
84 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0433  hypothetical protein  47.5 
 
 
83 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  51.85 
 
 
80 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0423  hypothetical protein  47.5 
 
 
83 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.407263  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2251  transglycosylase-associated protein  39.53 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0500758  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 
86 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1676  Transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  48.75 
 
 
84 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  48.75 
 
 
84 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 
86 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  35.8 
 
 
83 aa  50.8  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  43.75 
 
 
323 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  45.57 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  42.67 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1248  transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.251967  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4705  transglycosylase-associated protein  40.96 
 
 
83 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0185222 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  47.5 
 
 
79 aa  47.4  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  41.98 
 
 
84 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  43.75 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  46.25 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4274  hypothetical protein  43.21 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.126831  hitchhiker  0.00313613 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0899  transglycosylase-associated protein  43.21 
 
 
83 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0924  hypothetical protein  43.21 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 
86 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3969  transglycosylase-associated protein  41.18 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709132  normal  0.0745804 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1155  hypothetical protein  43.21 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0909  hypothetical protein  43.21 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000195971  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  43.9 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1028  hypothetical protein  43.21 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  43.9 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4026  transglycosylase-associated protein  35.71 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.846524  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1064  hypothetical protein  43.21 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6423e-37 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  41.33 
 
 
82 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  43.9 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0988  hypothetical protein  43.21 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0892  hypothetical protein  43.21 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4484  transglycosylase-associated protein  35.71 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.909812  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  40.7 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4838  hypothetical protein  34.12 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  43.75 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1082  hypothetical protein  41.98 
 
 
83 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4051  transglycosylase-associated protein  36.9 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220096  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3381  hypothetical protein  41.18 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.470225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 
86 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4202  Transglycosylase-associated protein  40.74 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  47.37 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5929  hypothetical protein  43.84 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3356  hypothetical protein  40 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  40.51 
 
 
101 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0123  transglycosylase-associated protein  43.84 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  44.3 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2641  hypothetical protein  47.62 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.271706  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1629  transglycosylase-associated protein  43.04 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  37.65 
 
 
79 aa  42.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  45.57 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2926  hypothetical protein  49.37 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000491326  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3537  Transglycosylase-associated protein  50 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.796504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3146  hypothetical protein  38.82 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177868  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0866  hypothetical protein  40 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3381  hypothetical protein  38.82 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2890  hypothetical protein  49.37 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011999 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3382  hypothetical protein  38.82 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0674128  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3056  hypothetical protein  38.82 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000292001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2938  hypothetical protein  49.37 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3162  hypothetical protein  38.82 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00262305  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3411  hypothetical protein  38.82 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627369  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2887  hypothetical protein  49.37 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.471323  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2618  hypothetical protein  49.37 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.434987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2692  hypothetical protein  49.37 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00157734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1870  hypothetical protein  38.82 
 
 
82 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2936  Transglycosylase-associated protein  38.1 
 
 
90 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  36.84 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1911  transglycosylase-associated protein  40 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233889  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  45 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  38.16 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0789  Transglycosylase-associated protein  42.42 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2903  hypothetical protein  46.84 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.675499  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3461  transglycosylase-associated protein  38.75 
 
 
84 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  58.97 
 
 
85 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  36.36 
 
 
89 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3529  transglycosylase-associated protein  35.06 
 
 
80 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4744  Transglycosylase-associated protein  39.71 
 
 
85 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>