129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3537 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3537  Transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 91 aa  162  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.796504  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  63.41 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  52.44 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  51.14 
 
 		 85 aa  71.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  56.96 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  50 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3901  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  53.76 
 
 		 88 aa  70.1  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  51.81 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  49.43 
 
 		 82 aa  67  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  49.43 
 
 		 83 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  51.19 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  44.57 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  47.62 
 
 		 82 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2513  transglycosylase-associated protein  44.71 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.855723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  47.62 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  48.28 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3344  transglycosylase-associated protein  61.4 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.121205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4346  transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134878 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  40.22 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  42.67 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  45.78 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3074  transglycosylase-associated protein  56.45 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  51.28 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  49.38 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  39.13 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  43.68 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0433  transglycosylase-associated protein, putative  38.55 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  41.25 
 
 		 323 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0440  putative transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  43.37 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  44.05 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  43.75 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  44.05 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  42.68 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  42.5 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  42.68 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  42.68 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  42.68 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  42.68 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  46.05 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  42.17 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  42.17 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  41.46 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  40.96 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  40.96 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  42.5 
 
 		 84 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  42.5 
 
 		 84 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  43.75 
 
 		 83 aa  50.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  42.5 
 
 		 84 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  42.05 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  45 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  40.96 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3340  hypothetical protein  51.32 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  39.53 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2251  transglycosylase-associated protein  61.54 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0500758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  41.86 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  42.17 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0123  transglycosylase-associated protein  40 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0544  transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.488698  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3895  transglycosylase-associated protein  34.52 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.720352  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  40.24 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 		 83 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  37.04 
 
 		 82 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  37.04 
 
 		 82 aa  48.9  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  37.04 
 
 		 82 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  39.02 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  36.47 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  36.14 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0860  transglycosylase-associated protein  41.1 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  40.74 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  33.33 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2225  Transglycosylase-associated protein  38.27 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956968  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  35.53 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  35.29 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  39.51 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  39.08 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2654  transglycosylase-associated protein  48.48 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.299446  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  52.08 
 
 		 85 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  38.16 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  38.16 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  38.16 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  38.16 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  38.16 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  38.75 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  34.57 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0423  hypothetical protein  45 
 
 		 83 aa  44.3  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.407263  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0433  hypothetical protein  45 
 
 		 83 aa  44.3  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3529  transglycosylase-associated protein  36.05 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  37.04 
 
 		 79 aa  43.5  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  47.06 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  47.06 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3477  hypothetical protein  40.66 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  41.18 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  36.71 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  38.16 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34490  predicted membrane protein  45.1 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  47.06 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  47.06 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  49.02 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>