109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4325 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 88 aa  160  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  78.05 
 
 		 84 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  76.83 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  73.49 
 
 		 83 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  73.49 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  73.49 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  73.49 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  70.73 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  70.73 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4121  transglycosylase-associated protein  70.11 
 
 		 116 aa  104  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000759893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  68.18 
 
 		 323 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  74.07 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1601  transglycosylase associated protein family  68.97 
 
 		 117 aa  97.8  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0149  hypothetical protein  68.97 
 
 		 115 aa  97.1  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  71.08 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  71.08 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2627  hypothetical protein  69.88 
 
 		 83 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2932  hypothetical protein  69.88 
 
 		 83 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2995  hypothetical protein  69.88 
 
 		 83 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.401136  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0997  hypothetical protein  71.05 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  53.16 
 
 		 80 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1911  transglycosylase-associated protein  51.85 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3461  transglycosylase-associated protein  50.62 
 
 		 84 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  51.9 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  50.62 
 
 		 84 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  49.37 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  51.28 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  48.72 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  49.33 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6259  hypothetical protein  55.07 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  51.9 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  51.28 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  43.75 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1208  transglycosylase-associated protein  53.85 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000243492  normal  0.0290476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3017  hypothetical protein  46.38 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  48.78 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0123  transglycosylase-associated protein  49.25 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  46.91 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4137  Transglycosylase-associated protein  48.15 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0915055  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  40.26 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  47.56 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3895  transglycosylase-associated protein  41.1 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.720352  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  40 
 
 		 86 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  36.05 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0805  transglycosylase-associated protein  51.85 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3901  transglycosylase-associated protein  41.25 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  46.25 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  45.57 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  39.19 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1818  Transglycosylase-associated protein  42.42 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0629036  decreased coverage  0.000804955 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  43.75 
 
 		 82 aa  48.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  42.5 
 
 		 82 aa  47.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  42.5 
 
 		 82 aa  47.8  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  42.5 
 
 		 82 aa  47.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  42.68 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1609  conserved hypothetical conserved membrane protein  41.18 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1802  hypothetical protein  41.18 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.020628  hitchhiker  0.0021209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2221  transglycosylase-associated protein  37.68 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.024328  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2918  transglycosylase-associated protein  48.75 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  41.46 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  49.15 
 
 		 85 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  43.02 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  43.04 
 
 		 87 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  40.51 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  40.24 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1472  Transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  37.18 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  37.84 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  37.84 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  40.48 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  39.02 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  39.02 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  39.02 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3529  transglycosylase-associated protein  39.44 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  35.8 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  45.12 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  38.27 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  35.9 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  39.02 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  41.98 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  40.24 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  39.51 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  39.51 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  39.51 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  39.51 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  39.51 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0544  transglycosylase-associated protein  41.56 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.488698  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  39.02 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0566  Transglycosylase-associated protein  48.78 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.644317  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  39.02 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  39.02 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  39.02 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  39.02 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1988  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.928213  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  36.59 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  40.24 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  39.76 
 
 		 88 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3814  transglycosylase-associated protein  46.51 
 
 		 86 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.781187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0860  transglycosylase-associated protein  40 
 
 		 85 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.145292 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>