53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0566 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0566  Transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 83 aa  143  9e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.644317  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  63.75 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  62.5 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  53.09 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  53.09 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  51.22 
 
 		 83 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  51.85 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  48.78 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  49.38 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  48.78 
 
 		 80 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3461  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1911  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  46.91 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6259  hypothetical protein  44.93 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4121  transglycosylase-associated protein  50.62 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000759893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  42.67 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  43.75 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  48.15 
 
 		 323 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  40.79 
 
 		 84 aa  51.6  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0149  hypothetical protein  48.15 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1601  transglycosylase associated protein family  48.15 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  47.56 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  45.68 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  47.56 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  42.17 
 
 		 84 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  39.74 
 
 		 82 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2995  hypothetical protein  47.56 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.401136  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2932  hypothetical protein  47.56 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2627  hypothetical protein  47.56 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  38.27 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0805  transglycosylase-associated protein  67.5 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0997  hypothetical protein  48.68 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3529  transglycosylase-associated protein  38.36 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3017  hypothetical protein  41.79 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4137  Transglycosylase-associated protein  46.25 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0915055  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  38.1 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1818  Transglycosylase-associated protein  38.81 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0629036  decreased coverage  0.000804955 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1208  transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000243492  normal  0.0290476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  34.07 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  38.1 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2918  transglycosylase-associated protein  55.56 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2221  transglycosylase-associated protein  45.9 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.024328  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3074  transglycosylase-associated protein  39.06 
 
 		 101 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  43.75 
 
 		 84 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  32.88 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2513  transglycosylase-associated protein  35.44 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.855723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  35.62 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  37.8 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>