97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2918 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2918  transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 81 aa  135  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1911  transglycosylase-associated protein  70.89 
 
 		 84 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3461  transglycosylase-associated protein  69.62 
 
 		 84 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  62.5 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  62.5 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  62.5 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  60.76 
 
 		 84 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  58.23 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  60.76 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  57.5 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  53.09 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  53.09 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4137  Transglycosylase-associated protein  65.82 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0915055  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  55 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  55 
 
 		 84 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  61.73 
 
 		 323 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6259  hypothetical protein  56.72 
 
 		 81 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0149  hypothetical protein  61.73 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4121  transglycosylase-associated protein  60 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000759893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1601  transglycosylase associated protein family  62.5 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  61.25 
 
 		 84 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  61.25 
 
 		 84 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  53.75 
 
 		 84 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2627  hypothetical protein  62.5 
 
 		 83 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2932  hypothetical protein  62.5 
 
 		 83 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2995  hypothetical protein  62.5 
 
 		 83 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.401136  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  48.75 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  51.25 
 
 		 79 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0997  hypothetical protein  62.34 
 
 		 77 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  55 
 
 		 78 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  50.62 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  46.25 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3017  hypothetical protein  56.45 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  45.68 
 
 		 80 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0805  transglycosylase-associated protein  50.62 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2221  transglycosylase-associated protein  53.03 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.024328  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  45 
 
 		 80 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1208  transglycosylase-associated protein  43.75 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000243492  normal  0.0290476 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3529  transglycosylase-associated protein  43.04 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1472  Transglycosylase-associated protein  53.23 
 
 		 86 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  42.53 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  40.26 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  42.17 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1980  transglycosylase-associated protein  56.58 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 		 89 aa  47.4  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  42.17 
 
 		 84 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1802  hypothetical protein  44.59 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.020628  hitchhiker  0.0021209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1609  conserved hypothetical conserved membrane protein  44.59 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  40.96 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0123  transglycosylase-associated protein  43.06 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  40.96 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  40.96 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1988  transglycosylase-associated protein  45 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.928213  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  43.02 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  43.02 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  44.19 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  43.02 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  43.02 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  55.32 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  43.02 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  46.34 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  46.34 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  46.34 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  46.34 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  40.74 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  46.34 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2694  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.975215  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  37.5 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  41.86 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  37.93 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3074  transglycosylase-associated protein  41.94 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  34.52 
 
 		 85 aa  44.3  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  39.08 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  43.9 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3814  transglycosylase-associated protein  44 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.781187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  32.43 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0566  Transglycosylase-associated protein  54.88 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.644317  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0212  Transglycosylase-associated protein  44 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1870  hypothetical protein  45.78 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3344  transglycosylase-associated protein  42.62 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.121205 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3356  hypothetical protein  44.58 
 
 		 82 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  32.43 
 
 		 82 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3146  hypothetical protein  44.58 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3056  hypothetical protein  44.58 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000292001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3411  hypothetical protein  44.58 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3162  hypothetical protein  44.58 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00262305  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  37.84 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3381  hypothetical protein  44.58 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3382  hypothetical protein  44.58 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0674128  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  43.9 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  36.14 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  41.18 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  39.53 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>