121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3969 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  100 
 
 
83 aa  150  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  78.31 
 
 
83 aa  121  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  60.23 
 
 
88 aa  92.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  57.83 
 
 
82 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  54.65 
 
 
88 aa  78.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3901  transglycosylase-associated protein  53.41 
 
 
85 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  54.65 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  52.27 
 
 
85 aa  75.5  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  47.73 
 
 
88 aa  68.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  48.19 
 
 
83 aa  65.5  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  45 
 
 
323 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4346  transglycosylase-associated protein  41.3 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0134878 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  44.05 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0486  Transglycosylase-associated protein  40.23 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  39.08 
 
 
86 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  46.15 
 
 
84 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  44.32 
 
 
103 aa  57  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  48.78 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3477  hypothetical protein  44.05 
 
 
89 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  35.71 
 
 
86 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2251  transglycosylase-associated protein  41.38 
 
 
89 aa  53.9  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0500758  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  49.38 
 
 
83 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  47.56 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  47.56 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  47.56 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  47.56 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0261  transglycosylase-associated protein  36.78 
 
 
87 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  47.67 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  47.67 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  40 
 
 
89 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  40.48 
 
 
84 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0423  hypothetical protein  47.44 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.407263  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  40.48 
 
 
84 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0433  hypothetical protein  47.44 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 
84 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 
84 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 
84 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1601  transglycosylase associated protein family  45 
 
 
117 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0149  hypothetical protein  45 
 
 
115 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  45.68 
 
 
80 aa  50.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  40.96 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  40.96 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  36.78 
 
 
88 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  47.56 
 
 
80 aa  50.4  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  44.83 
 
 
84 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  39.76 
 
 
84 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  39.76 
 
 
84 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  35.63 
 
 
90 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  43.68 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2627  hypothetical protein  44.44 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2932  hypothetical protein  44.44 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2995  hypothetical protein  44.44 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.401136  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  39.76 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3461  transglycosylase-associated protein  46.25 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  45.12 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  45.12 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  38.1 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1150  Transglycosylase-associated protein  36.47 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000224941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1911  transglycosylase-associated protein  45 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233889  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  43.02 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0805  transglycosylase-associated protein  42.03 
 
 
86 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4838  hypothetical protein  36.25 
 
 
87 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4121  transglycosylase-associated protein  55.32 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000759893  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0997  hypothetical protein  44.16 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1980  transglycosylase-associated protein  45.21 
 
 
82 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3529  transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1481  hypothetical protein  35.29 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0384387  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1676  Transglycosylase-associated protein  42.67 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  33.73 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34490  predicted membrane protein  34.72 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974959  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  34.52 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  36.05 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  56.41 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2694  transglycosylase-associated protein  42.47 
 
 
80 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.975215  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  30.49 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1082  hypothetical protein  37.97 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  48.1 
 
 
78 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  39.47 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  39.47 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  39.47 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  39.47 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  39.47 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  34.88 
 
 
88 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0924  hypothetical protein  37.97 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0909  hypothetical protein  37.97 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000195971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0988  hypothetical protein  37.97 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  41.77 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  43.53 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0544  transglycosylase-associated protein  36.9 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.488698  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  38.16 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0899  transglycosylase-associated protein  37.97 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  38.16 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14550  hypothetical protein  37.21 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1155  hypothetical protein  37.97 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1028  hypothetical protein  37.97 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4274  hypothetical protein  37.97 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.126831  hitchhiker  0.00313613 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>