90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3477 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3477  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  160  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1150  Transglycosylase-associated protein  66.67 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000224941 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37700  Transglycosylase associated protein  71.76 
 
 
88 aa  105  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.565098  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  59.09 
 
 
88 aa  96.7  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0486  Transglycosylase-associated protein  60 
 
 
88 aa  94.7  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  55.81 
 
 
90 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1481  hypothetical protein  54.02 
 
 
88 aa  88.2  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0384387  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  50.57 
 
 
87 aa  83.6  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0261  transglycosylase-associated protein  54.55 
 
 
87 aa  83.6  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1484  hypothetical protein  51.72 
 
 
91 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101926 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14550  hypothetical protein  53.33 
 
 
90 aa  82  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3565  hypothetical protein  65.75 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0385  Transglycosylase-associated protein  47.13 
 
 
87 aa  60.5  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23330  hypothetical protein  47.73 
 
 
88 aa  60.1  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0997983  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  46.15 
 
 
82 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  41.38 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  45.57 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  45.33 
 
 
84 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  41.03 
 
 
86 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  42.31 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  43.21 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  43.21 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 
84 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  43.21 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  43.59 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  39.74 
 
 
84 aa  57.4  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0544  transglycosylase-associated protein  43.02 
 
 
87 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.488698  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  39.74 
 
 
84 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  39.74 
 
 
84 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  45.88 
 
 
83 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  43.59 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  43.59 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  43.59 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  43.59 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  39.74 
 
 
84 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  43.59 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  44 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  44 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  44.05 
 
 
83 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  44 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  44 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  44 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  44 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 
87 aa  53.9  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  42.67 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  39.08 
 
 
84 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  39.77 
 
 
86 aa  50.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  32.95 
 
 
87 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  38.37 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  44.19 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2225  Transglycosylase-associated protein  44.87 
 
 
82 aa  48.1  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956968  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  44.87 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  44.87 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  44.87 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  44.87 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  44.87 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  44.87 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  44.87 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  44.87 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  44.87 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  35.29 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  46.15 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  40 
 
 
85 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  37.65 
 
 
85 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  37.5 
 
 
86 aa  47  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  37.08 
 
 
88 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  37.08 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  42.35 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0996  transglycosylase-associated protein  39.77 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000193935  normal  0.29992 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2936  Transglycosylase-associated protein  34.12 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  32.56 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3822  transglycosylase-associated protein  34.44 
 
 
90 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0470364  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  32.94 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2009  transglycosylase-associated protein  40 
 
 
91 aa  43.9  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000234681  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1900  Transglycosylase-associated protein  32.94 
 
 
90 aa  43.5  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  34.12 
 
 
88 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0941  transglycosylase-associated protein  49.09 
 
 
90 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.44125  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2247  hypothetical protein  42.31 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2554  hypothetical protein  42.31 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0440  putative transglycosylase-associated protein  37.21 
 
 
86 aa  42.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0123  transglycosylase-associated protein  41.38 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0433  transglycosylase-associated protein, putative  37.21 
 
 
86 aa  42.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  37.65 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 
86 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0937  transglycosylase-associated protein  36.96 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.324449  normal  0.445038 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  31.58 
 
 
323 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  32.56 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5929  hypothetical protein  30.68 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3969  transglycosylase-associated protein  27.38 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709132  normal  0.0745804 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002896  transglycosylase associated protein  50 
 
 
82 aa  40  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>