48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_15410 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  100 
 
 		 88 aa  169  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  47.62 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  44.05 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3901  transglycosylase-associated protein  45.68 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  43.21 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  42.05 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  42.35 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  38.82 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  44.71 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  41.46 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  37.65 
 
 		 86 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  46.15 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  38.82 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3477  hypothetical protein  35.29 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  34.88 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  36.05 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  38.82 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  43.04 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  44.3 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  42.5 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  40.7 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_004310  BR0433  transglycosylase-associated protein, putative  34.88 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0440  putative transglycosylase-associated protein  34.88 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  38.75 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  37.65 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  36.78 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  32.18 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  37.8 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0544  transglycosylase-associated protein  31.4 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.488698  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34490  predicted membrane protein  35.71 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4838  hypothetical protein  35.37 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  36.9 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  36.71 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3822  transglycosylase-associated protein  36.78 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0470364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  38.82 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  32.18 
 
 		 96 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0261  transglycosylase-associated protein  36.59 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4346  transglycosylase-associated protein  48.78 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134878 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  35 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24860  Transglycosylase associated protein  38.57 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180494  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  31.58 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2251  transglycosylase-associated protein  52.78 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0500758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3537  Transglycosylase-associated protein  49.33 
 
 		 91 aa  40.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.796504  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  32.5 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  34.57 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  33.33 
 
 		 83 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2307  hypothetical protein  36.54 
 
 		 92 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.140114  normal  0.0177881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>