101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0910 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  100 
 
 
80 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  63.29 
 
 
79 aa  90.5  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  60.76 
 
 
79 aa  89.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  67.09 
 
 
84 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  67.09 
 
 
84 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  62.5 
 
 
80 aa  85.9  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  67.09 
 
 
80 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  62.82 
 
 
84 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  61.54 
 
 
84 aa  83.6  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  63.29 
 
 
84 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  63.29 
 
 
84 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  63.29 
 
 
84 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  63.29 
 
 
83 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  57.69 
 
 
323 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  57.69 
 
 
84 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  55.84 
 
 
83 aa  78.2  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  53.16 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4121  transglycosylase-associated protein  65.38 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000759893  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  60.56 
 
 
78 aa  70.1  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1208  transglycosylase-associated protein  62.03 
 
 
79 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000243492  normal  0.0290476 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  52.5 
 
 
84 aa  68.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  51.25 
 
 
84 aa  67.4  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  48.75 
 
 
84 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1601  transglycosylase associated protein family  57.69 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0149  hypothetical protein  57.69 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2627  hypothetical protein  56.96 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2932  hypothetical protein  56.96 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2995  hypothetical protein  56.96 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.401136  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1911  transglycosylase-associated protein  46.25 
 
 
84 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233889  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  55.7 
 
 
84 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  55.7 
 
 
84 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3461  transglycosylase-associated protein  45 
 
 
84 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0997  hypothetical protein  55.84 
 
 
77 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0860  transglycosylase-associated protein  56.25 
 
 
85 aa  60.1  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  45.45 
 
 
101 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1988  transglycosylase-associated protein  59.49 
 
 
79 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.928213  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0805  transglycosylase-associated protein  51.85 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0493  transglycosylase-associated protein  54.24 
 
 
83 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3017  hypothetical protein  52.24 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6259  hypothetical protein  49.25 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196091  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4169  transglycosylase-associated protein  41.79 
 
 
82 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  51.85 
 
 
82 aa  55.1  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  45.24 
 
 
88 aa  54.7  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  53.45 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3074  transglycosylase-associated protein  47.62 
 
 
101 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270595  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3344  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
100 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.121205 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  46.25 
 
 
83 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0730  Transglycosylase-associated protein  64.56 
 
 
79 aa  51.6  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 
84 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  45.12 
 
 
83 aa  51.2  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3340  hypothetical protein  49.21 
 
 
83 aa  50.8  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679831  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  45.68 
 
 
83 aa  50.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0789  Transglycosylase-associated protein  41.54 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0123  transglycosylase-associated protein  45.83 
 
 
84 aa  50.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  40.85 
 
 
83 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4744  Transglycosylase-associated protein  40 
 
 
85 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3529  transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 
80 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  43.06 
 
 
103 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3901  transglycosylase-associated protein  45 
 
 
85 aa  50.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2654  transglycosylase-associated protein  44.78 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.299446  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  47.44 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  47.56 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1472  Transglycosylase-associated protein  50 
 
 
86 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434508  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  47.44 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  42.25 
 
 
83 aa  47.8  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1818  Transglycosylase-associated protein  40.91 
 
 
84 aa  47.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0629036  decreased coverage  0.000804955 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2513  transglycosylase-associated protein  43.28 
 
 
83 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.855723  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  37.5 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3356  hypothetical protein  45.57 
 
 
82 aa  47  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3162  hypothetical protein  45 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00262305  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3146  hypothetical protein  45 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3056  hypothetical protein  45 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000292001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3411  hypothetical protein  45 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627369  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  38.82 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  42.11 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3382  hypothetical protein  45 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0674128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3381  hypothetical protein  45 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  43.06 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0964  hypothetical protein  44.68 
 
 
83 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3895  transglycosylase-associated protein  40 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.720352  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  40.51 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  36.11 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  38.75 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  47.06 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  42.67 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1870  hypothetical protein  45 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3814  transglycosylase-associated protein  52 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.781187  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0212  Transglycosylase-associated protein  52 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  46.25 
 
 
87 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4137  Transglycosylase-associated protein  43.75 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0915055  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2221  transglycosylase-associated protein  41.79 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.024328  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2122  hypothetical protein  44.44 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3381  hypothetical protein  45 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.470225  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  42.68 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1609  conserved hypothetical conserved membrane protein  44.74 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1802  hypothetical protein  44.74 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.020628  hitchhiker  0.0021209 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 
89 aa  41.6  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  41.1 
 
 
84 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0433  transglycosylase-associated protein, putative  37.33 
 
 
86 aa  40.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>