74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6259 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6259  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1911  transglycosylase-associated protein  66.25 
 
 		 84 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3461  transglycosylase-associated protein  65 
 
 		 84 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  56.25 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  60.76 
 
 		 84 aa  83.6  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  59.49 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  52.5 
 
 		 84 aa  80.9  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  51.25 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  55.7 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  55.7 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  55.7 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  55.7 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  55.7 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  56.96 
 
 		 88 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  55.7 
 
 		 83 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4137  Transglycosylase-associated protein  62.5 
 
 		 84 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0915055  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  50.62 
 
 		 79 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  52.5 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  51.25 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  50.63 
 
 		 83 aa  70.9  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  50.62 
 
 		 80 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  45 
 
 		 80 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  54.43 
 
 		 84 aa  67  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  45.68 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  55.7 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  55.7 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0805  transglycosylase-associated protein  58.44 
 
 		 86 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0149  hypothetical protein  50.63 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  52 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4121  transglycosylase-associated protein  53.16 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000759893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1601  transglycosylase associated protein family  50.63 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1208  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 79 aa  62  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000243492  normal  0.0290476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3017  hypothetical protein  47.76 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2221  transglycosylase-associated protein  50.75 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.024328  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2995  hypothetical protein  50.63 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.401136  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2932  hypothetical protein  50.63 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235775  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0997  hypothetical protein  52 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2627  hypothetical protein  50.63 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1988  transglycosylase-associated protein  48.75 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.928213  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  41.56 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2918  transglycosylase-associated protein  58.02 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  46.75 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1472  Transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  42.11 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  48.48 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0123  transglycosylase-associated protein  45.21 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  43.21 
 
 		 82 aa  48.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  47.56 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3901  transglycosylase-associated protein  40.74 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  43.02 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  41.67 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3529  transglycosylase-associated protein  37.97 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  40.54 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0566  Transglycosylase-associated protein  51.22 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.644317  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  41.89 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  41.98 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1818  Transglycosylase-associated protein  40.91 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0629036  decreased coverage  0.000804955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  38.46 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1609  conserved hypothetical conserved membrane protein  47.14 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1802  hypothetical protein  47.14 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.020628  hitchhiker  0.0021209 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3074  transglycosylase-associated protein  38.71 
 
 		 101 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1065  Transglycosylase-associated protein  58.93 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0251318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  40.96 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1980  transglycosylase-associated protein  42.68 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  40.96 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  35.29 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4838  hypothetical protein  34.94 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  39.76 
 
 		 84 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  39.76 
 
 		 84 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>