37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3529 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3529  transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 80 aa  144  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  44.16 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  37.18 
 
 		 323 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  43.59 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  43.59 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  42.31 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  42.31 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  39.74 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  40.26 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  39.74 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  39.44 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  39.44 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1911  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  38.96 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  39.44 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  39.44 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  38.96 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  39.74 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  41.56 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3461  transglycosylase-associated protein  41.56 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  38.03 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  38.2 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  37.93 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3017  hypothetical protein  39.39 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3029  transglycosylase-associated protein  32.93 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  32.14 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0149  hypothetical protein  37.18 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1601  transglycosylase associated protein family  37.18 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  34.52 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  35.06 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4121  transglycosylase-associated protein  43.48 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000759893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>