57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6532 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 96 aa  186  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  80.21 
 
 		 96 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3895  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 92 aa  97.8  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.720352  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  58.97 
 
 		 83 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  51.85 
 
 		 84 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1818  Transglycosylase-associated protein  54.32 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0629036  decreased coverage  0.000804955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  45.12 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  45.68 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2513  transglycosylase-associated protein  42.68 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.855723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  46.25 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3029  transglycosylase-associated protein  38.67 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  46.75 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0493  transglycosylase-associated protein  46.15 
 
 		 83 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  42.31 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  42.31 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3340  hypothetical protein  37.5 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679831  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4744  Transglycosylase-associated protein  46.97 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  46.15 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  43.59 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  43.59 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  43.59 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4169  transglycosylase-associated protein  43.94 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  41.33 
 
 		 323 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0350  transglycosylase-associated protein  48.75 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.522608 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0789  Transglycosylase-associated protein  46.97 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  39.02 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3529  transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  32.53 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0860  transglycosylase-associated protein  41.54 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  37.18 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  43.06 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  38.89 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  37.5 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  39.74 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  39.74 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  36.11 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  40.24 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2654  transglycosylase-associated protein  37.88 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.299446  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  43.06 
 
 		 78 aa  42.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0544  transglycosylase-associated protein  39.24 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.488698  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  41.38 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  36.99 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  40 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  32.18 
 
 		 88 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 		 90 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  38.96 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  38.46 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  42.67 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  32.56 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_004310  BR0964  hypothetical protein  40.98 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  42.31 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  42.31 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  37.8 
 
 		 88 aa  40  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2251  transglycosylase-associated protein  34.09 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0500758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0440  putative transglycosylase-associated protein  40.24 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0433  transglycosylase-associated protein, putative  40.24 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>