62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11889 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  100 
 
 
101 aa  187  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3074  transglycosylase-associated protein  58.42 
 
 
101 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270595  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3344  transglycosylase-associated protein  56 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.121205 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  41.24 
 
 
103 aa  61.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  45.45 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  38.75 
 
 
323 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  45.45 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0123  transglycosylase-associated protein  44.29 
 
 
84 aa  53.9  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  40.74 
 
 
84 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  40.74 
 
 
84 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2513  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.855723  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  40.26 
 
 
88 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  44.16 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  38.46 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  40 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3895  transglycosylase-associated protein  36.47 
 
 
92 aa  50.8  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.720352  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  38.46 
 
 
84 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  38.82 
 
 
82 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  40.26 
 
 
83 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  42.86 
 
 
84 aa  50.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  38.46 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3537  Transglycosylase-associated protein  52.17 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.796504  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  39.53 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  38.96 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  38.96 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1911  transglycosylase-associated protein  41.56 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233889  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  41.67 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  38.96 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3461  transglycosylase-associated protein  41.56 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  40 
 
 
83 aa  47  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  40.26 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0805  transglycosylase-associated protein  54.17 
 
 
86 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  36.59 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4838  hypothetical protein  36.25 
 
 
87 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3340  hypothetical protein  44.12 
 
 
83 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679831  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  42.5 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  59.09 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  42.11 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  38.1 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  41.56 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4121  transglycosylase-associated protein  37.84 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000759893  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  40.51 
 
 
82 aa  43.5  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  40.79 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  41.77 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  37.84 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  37.97 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0433  transglycosylase-associated protein, putative  36.11 
 
 
86 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0440  putative transglycosylase-associated protein  36.11 
 
 
86 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0149  hypothetical protein  39.47 
 
 
115 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  33.73 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  37.65 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  38.96 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  32.56 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3901  transglycosylase-associated protein  35.44 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1601  transglycosylase associated protein family  39.47 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0261  transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  38.96 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6259  hypothetical protein  42.03 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196091  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>