63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0487 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 83 aa  144  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  61.04 
 
 		 79 aa  84.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.2  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  56.63 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  55.84 
 
 		 80 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  54.55 
 
 		 80 aa  78.2  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  47.5 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 80 aa  75.1  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  52.38 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  51.25 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  51.25 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  51.25 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  48.81 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  48.81 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  48.75 
 
 		 83 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  48.81 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  48.1 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  46.84 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1911  transglycosylase-associated protein  46.43 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0805  transglycosylase-associated protein  51.16 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  48.72 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  47.62 
 
 		 84 aa  63.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4121  transglycosylase-associated protein  51.25 
 
 		 116 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000759893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6259  hypothetical protein  50.75 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3461  transglycosylase-associated protein  44.05 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0149  hypothetical protein  47.5 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1601  transglycosylase associated protein family  47.5 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2932  hypothetical protein  47.5 
 
 		 83 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2627  hypothetical protein  47.5 
 
 		 83 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2995  hypothetical protein  47.5 
 
 		 83 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.401136  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  46.25 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  46.25 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  43.75 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  50.72 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1472  Transglycosylase-associated protein  54.84 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0997  hypothetical protein  46.05 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1208  transglycosylase-associated protein  51.95 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000243492  normal  0.0290476 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1988  transglycosylase-associated protein  53.25 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.928213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3017  hypothetical protein  43.94 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  40 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0860  transglycosylase-associated protein  40.62 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  42.17 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  41.46 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3529  transglycosylase-associated protein  38.96 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  36.71 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  35.9 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0433  hypothetical protein  45 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  44.3 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0423  hypothetical protein  45 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.407263  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2221  transglycosylase-associated protein  42.42 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.024328  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4137  Transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0915055  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  37.5 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  37.21 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3901  transglycosylase-associated protein  36.71 
 
 		 85 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  40.24 
 
 		 83 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1802  hypothetical protein  37.97 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.020628  hitchhiker  0.0021209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1609  conserved hypothetical conserved membrane protein  37.97 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  41.67 
 
 		 83 aa  42  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  32.53 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  40.28 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  36.36 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  37.97 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>