76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0860 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0860  transglycosylase-associated protein  100 
 
 
85 aa  154  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3029  transglycosylase-associated protein  48.72 
 
 
87 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3895  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
92 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.720352  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  45.24 
 
 
84 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  40.96 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  57.14 
 
 
80 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  45.68 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  46.58 
 
 
83 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  46.15 
 
 
323 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3340  hypothetical protein  45.71 
 
 
83 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679831  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  51.28 
 
 
83 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  48.72 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  48.72 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  48.72 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  43.06 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  46.34 
 
 
84 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  46.34 
 
 
84 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  44 
 
 
84 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  41.67 
 
 
79 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0493  transglycosylase-associated protein  45.76 
 
 
83 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  51.47 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  47.44 
 
 
84 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  47.44 
 
 
84 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  34.94 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4169  transglycosylase-associated protein  41.67 
 
 
82 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 
83 aa  50.1  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1818  Transglycosylase-associated protein  49.33 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0629036  decreased coverage  0.000804955 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2513  transglycosylase-associated protein  36.36 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.855723  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  40.24 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  42.47 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1208  transglycosylase-associated protein  54.17 
 
 
79 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000243492  normal  0.0290476 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  41.46 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 
80 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  50.68 
 
 
78 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2654  transglycosylase-associated protein  40 
 
 
83 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.299446  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  41.33 
 
 
83 aa  47.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  34.57 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4121  transglycosylase-associated protein  50.68 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000759893  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  33.33 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  39.53 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3896  hypothetical protein  48.05 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691411  normal  0.341955 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0149  hypothetical protein  46.15 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  40.91 
 
 
87 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1601  transglycosylase associated protein family  46.15 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  42.7 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0789  Transglycosylase-associated protein  45.76 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  40 
 
 
83 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  47.44 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4744  Transglycosylase-associated protein  47.37 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  47.44 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  38.82 
 
 
89 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0997  hypothetical protein  46.58 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2627  hypothetical protein  46.15 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2995  hypothetical protein  46.15 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.401136  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2932  hypothetical protein  46.15 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235775  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3017  hypothetical protein  53.33 
 
 
95 aa  43.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0350  transglycosylase-associated protein  39.76 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.522608 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  38.1 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  43.37 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  36.59 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4202  Transglycosylase-associated protein  33.75 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  36.36 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_004310  BR0964  hypothetical protein  36.36 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  36.71 
 
 
85 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4946  Transglycosylase-associated protein  39.74 
 
 
87 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177046  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  40.96 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0123  transglycosylase-associated protein  37.04 
 
 
84 aa  41.2  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3901  transglycosylase-associated protein  38.82 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1988  transglycosylase-associated protein  57.35 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.928213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3881  transglycosylase-associated protein  35.44 
 
 
86 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64509  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  37.66 
 
 
84 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  39.66 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 
83 aa  40  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>