40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2654 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2654  transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 83 aa  150  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.299446  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3340  hypothetical protein  87.95 
 
 		 83 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679831  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0493  transglycosylase-associated protein  79.1 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  59.04 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4169  transglycosylase-associated protein  72.73 
 
 		 82 aa  94.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  60.24 
 
 		 84 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_004310  BR0964  hypothetical protein  71.19 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  51.22 
 
 		 83 aa  83.6  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2513  transglycosylase-associated protein  56.41 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.855723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  51.25 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  51.28 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1818  Transglycosylase-associated protein  61.45 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0629036  decreased coverage  0.000804955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  52.56 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4744  Transglycosylase-associated protein  61.29 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0789  Transglycosylase-associated protein  59.68 
 
 		 85 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0350  transglycosylase-associated protein  58.97 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.522608 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2122  hypothetical protein  44.44 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3895  transglycosylase-associated protein  39.76 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.720352  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  37.8 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  36.59 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  45.71 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  44.87 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  45.21 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  37.66 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  43.21 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  47.69 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  43.21 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0860  transglycosylase-associated protein  38.6 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  38.82 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  37.66 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  38.96 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  42.31 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 		 84 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  42.65 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 88 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4838  hypothetical protein  46.34 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  41.67 
 
 		 83 aa  41.2  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  43.1 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  42.65 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  52.38 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>