58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2122 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2122  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  157  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  59.76 
 
 		 82 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  58.54 
 
 		 82 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  47.62 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  47.56 
 
 		 83 aa  73.9  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1818  Transglycosylase-associated protein  52.38 
 
 		 84 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0629036  decreased coverage  0.000804955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  45.68 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  47.62 
 
 		 83 aa  68.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3340  hypothetical protein  41.98 
 
 		 83 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679831  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2513  transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.855723  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  43.21 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0789  Transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4169  transglycosylase-associated protein  47.76 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2654  transglycosylase-associated protein  44.12 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.299446  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4744  Transglycosylase-associated protein  48.44 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  39.76 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  39.76 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  41.98 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  41.56 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  42.53 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  42.17 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0493  transglycosylase-associated protein  42.65 
 
 		 83 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  38.55 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  44.05 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  35.44 
 
 		 323 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  38.27 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  43.24 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  40.54 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  40.54 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  40.54 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  40.54 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0964  hypothetical protein  42.37 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  40.54 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  38.96 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  37.66 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  37.84 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  38.82 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0350  transglycosylase-associated protein  40.74 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.522608 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  39.19 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  40.54 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  42.67 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3029  transglycosylase-associated protein  36.49 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6259  hypothetical protein  37.88 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3017  hypothetical protein  35.21 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0423  hypothetical protein  35 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.407263  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4838  hypothetical protein  45.65 
 
 		 87 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0433  hypothetical protein  35 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  35.62 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2221  transglycosylase-associated protein  36.62 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.024328  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  40.54 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  40.54 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  36.14 
 
 		 84 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  40.68 
 
 		 85 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>