138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0133 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  83.52 
 
 
223 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  67.05 
 
 
93 aa  120  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  39.76 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2936  Transglycosylase-associated protein  43.48 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1900  Transglycosylase-associated protein  45.16 
 
 
90 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  36.14 
 
 
101 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  41.67 
 
 
90 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  34.88 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  43.68 
 
 
87 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  36.96 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  43.42 
 
 
84 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  37.21 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2260  hypothetical protein  39.77 
 
 
90 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880051  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  40.79 
 
 
84 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  40.79 
 
 
84 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  35.21 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1872  hypothetical protein  41.38 
 
 
86 aa  55.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.03815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  35.21 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  35.21 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  39.47 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  39.47 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  44.07 
 
 
88 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  39.24 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  39.47 
 
 
84 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  43.42 
 
 
82 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  43.42 
 
 
82 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  43.42 
 
 
82 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  43.42 
 
 
82 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  43.42 
 
 
82 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  36.84 
 
 
84 aa  53.9  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  41.49 
 
 
93 aa  53.9  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0486  Transglycosylase-associated protein  40.24 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1150  Transglycosylase-associated protein  39.08 
 
 
89 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000224941 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  38.16 
 
 
84 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  38.16 
 
 
84 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  38.16 
 
 
84 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  38.16 
 
 
84 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  38.16 
 
 
84 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2791  transglycosylase-associated protein  43.42 
 
 
84 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  56 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  32.94 
 
 
87 aa  53.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3969  transglycosylase-associated protein  42.17 
 
 
85 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709132  normal  0.0745804 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  36.84 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  39.47 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  36.84 
 
 
84 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4503  Transglycosylase-associated protein  36.36 
 
 
88 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  42.11 
 
 
86 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  36.84 
 
 
82 aa  51.2  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  53.33 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 
90 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0261  transglycosylase-associated protein  39.02 
 
 
87 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  38.67 
 
 
91 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0177  hypothetical protein  38.95 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  44.3 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  34.88 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4705  transglycosylase-associated protein  41.56 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0185222 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  44.3 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  36.36 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4946  Transglycosylase-associated protein  35.29 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177046  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4021  transglycosylase-associated protein  35.23 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.360585  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4390  Transglycosylase-associated protein  35.23 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.272942 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5242  transglycosylase-associated protein  43.37 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14550  hypothetical protein  31.82 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  39.47 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  39.47 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  39.47 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4202  Transglycosylase-associated protein  38.96 
 
 
83 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  38.16 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5929  hypothetical protein  43.37 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  38.18 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02247  transglycosylase-associated protein  36.49 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  34.41 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5383  transglycosylase-associated protein  42.17 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5492  hypothetical protein  43.42 
 
 
81 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  43.64 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  43.64 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5046  transglycosylase-associated protein  43.42 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  43.64 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  43.64 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  43.64 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  43.64 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  43.64 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  43.64 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  43.64 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5334  transglycosylase-associated protein  40.96 
 
 
81 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4026  transglycosylase-associated protein  40.58 
 
 
84 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.846524  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4484  transglycosylase-associated protein  40.58 
 
 
84 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.909812  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0110  transglycosylase-associated protein  45.31 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  36.84 
 
 
82 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2225  Transglycosylase-associated protein  41.82 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956968  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5231  transglycosylase-associated protein  37.65 
 
 
83 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5620  transglycosylase-associated protein  44.74 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.969683  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1248  transglycosylase-associated protein  40.58 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.251967  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4912  hypothetical protein  45.45 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.59341  hitchhiker  0.00462659 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>