58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6910 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 90 aa  158  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  86.67 
 
 		 90 aa  138  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  71.59 
 
 		 88 aa  106  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  65.52 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  55.56 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  64.77 
 
 		 91 aa  98.2  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  52.22 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  59.09 
 
 		 101 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  55.68 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  54.76 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  54.76 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  54.76 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  60.92 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  59.52 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3919  hypothetical protein  65.22 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.121019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0110  transglycosylase-associated protein  71.83 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1048  hypothetical protein  55.7 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000383813  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2260  hypothetical protein  46.59 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880051  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3461  hypothetical protein  48.61 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  61.19 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  59.77 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0966  hypothetical protein  62.69 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2498  hypothetical protein  56.92 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.049765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  48.75 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0503  transglycosylase-associated protein  64.41 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.83722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2545  putative signal peptide  43.59 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  46.05 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0056  integral membrane protein  48.08 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13836  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  38.37 
 
 		 223 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  38.75 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  36.36 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  39.02 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1471  integral membrane protein  35.48 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  38.55 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2571  hypothetical protein  38.37 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.725276  normal  0.146538 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  34.88 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  34.88 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  34.88 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  51.79 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  35.87 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  35.21 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  35.21 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  35.21 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  35.21 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  35.21 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  42.37 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  37.93 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  31.71 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  37.93 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0486  Transglycosylase-associated protein  32.56 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2768  hypothetical protein  39.08 
 
 		 114 aa  40  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111053  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>