42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2399 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  169  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  56.67 
 
 		 91 aa  103  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  52.22 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  52.22 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  54.65 
 
 		 88 aa  92.8  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  49.43 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  47.19 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  51.11 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  46.59 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3919  hypothetical protein  57.75 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.121019 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  47.73 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  43.9 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  43.9 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  43.9 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3461  hypothetical protein  48.53 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  52.31 
 
 		 88 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2498  hypothetical protein  44.44 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.049765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1048  hypothetical protein  48.05 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000383813  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  43.59 
 
 		 99 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0966  hypothetical protein  50.75 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0110  transglycosylase-associated protein  56.34 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  44.83 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  45.98 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2545  putative signal peptide  49.18 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0503  transglycosylase-associated protein  49.15 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.83722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  34.15 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  41.67 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  41.67 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  41.67 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  38.1 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2260  hypothetical protein  41.77 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  38.1 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2571  hypothetical protein  49.09 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.725276  normal  0.146538 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  32.56 
 
 		 93 aa  48.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  34.85 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1900  Transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1872  hypothetical protein  32.5 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.03815  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1471  integral membrane protein  37.7 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  33.33 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2936  Transglycosylase-associated protein  41.18 
 
 		 90 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  43.55 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  43.55 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>