72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0965 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 88 aa  157  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  57.83 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  58.33 
 
 		 91 aa  87.4  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  58.97 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  55.95 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  57.5 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  54.79 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  51.85 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  54.02 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1048  hypothetical protein  50.65 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000383813  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  45.35 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  46.05 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  46.05 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  46.05 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0966  hypothetical protein  53.73 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  45.56 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2498  hypothetical protein  51.52 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.049765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  50.67 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  45.57 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2260  hypothetical protein  44.32 
 
 		 90 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880051  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  47.46 
 
 		 223 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3461  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  60.1  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0110  transglycosylase-associated protein  62.32 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3919  hypothetical protein  60.38 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.121019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0503  transglycosylase-associated protein  50.85 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.83722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2545  putative signal peptide  43.04 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  45 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  61.22 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  41.18 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  44.07 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  44.07 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  44.07 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1872  hypothetical protein  46.05 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.03815  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1471  integral membrane protein  36.23 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  41.25 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  43.02 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2936  Transglycosylase-associated protein  37.36 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1900  Transglycosylase-associated protein  37.78 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  36 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  36 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  36 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  36 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  36 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  36 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  34.57 
 
 		 86 aa  43.5  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  36 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  38.6 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.94994 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  38.6 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  38.6 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  38.6 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  38.6 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  38.6 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  38.6 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  38.6 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  38.6 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  39.74 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2307  hypothetical protein  38.46 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.140114  normal  0.0177881 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2225  Transglycosylase-associated protein  36.21 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956968  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  34.57 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  42.59 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  42.59 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2247  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  42.59 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  42.59 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  42.59 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2554  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  42.59 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  36 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  36 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  36 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  42.86 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>