129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3870 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  100 
 
 
223 aa  441  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  83.52 
 
 
96 aa  138  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  83.52 
 
 
96 aa  138  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  83.52 
 
 
96 aa  138  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  72.73 
 
 
93 aa  127  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  43.21 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  44.58 
 
 
88 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2936  Transglycosylase-associated protein  44.68 
 
 
90 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  44.44 
 
 
87 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  41.11 
 
 
101 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1900  Transglycosylase-associated protein  45.65 
 
 
90 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  38.37 
 
 
88 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  47.46 
 
 
88 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  38.1 
 
 
90 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1872  hypothetical protein  42.53 
 
 
86 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.03815  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  45.45 
 
 
91 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  36.71 
 
 
102 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  36.71 
 
 
102 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  36.71 
 
 
102 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  43.82 
 
 
93 aa  56.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  39.47 
 
 
84 aa  55.1  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  58 
 
 
83 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  42.47 
 
 
89 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  41.86 
 
 
90 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  45.83 
 
 
86 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  41.3 
 
 
91 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  45.45 
 
 
88 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  37.97 
 
 
89 aa  52.8  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  36.84 
 
 
84 aa  52.8  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  40.79 
 
 
82 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  40.79 
 
 
82 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  40.79 
 
 
82 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  40.79 
 
 
82 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  40.79 
 
 
82 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  38.16 
 
 
84 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  38.16 
 
 
84 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  38.16 
 
 
84 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  36.84 
 
 
84 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  36.84 
 
 
86 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  36.84 
 
 
84 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2791  transglycosylase-associated protein  40.79 
 
 
84 aa  52  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  36.84 
 
 
84 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  36.84 
 
 
84 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  36.84 
 
 
84 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  36.84 
 
 
84 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  36.84 
 
 
84 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 
90 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14550  hypothetical protein  38.64 
 
 
90 aa  51.2  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  38.16 
 
 
82 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  34.12 
 
 
87 aa  50.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  36.84 
 
 
82 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3969  transglycosylase-associated protein  40.58 
 
 
85 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709132  normal  0.0745804 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4705  transglycosylase-associated protein  44.93 
 
 
83 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0185222 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  35.53 
 
 
84 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 
88 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  43.64 
 
 
82 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  43.64 
 
 
82 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5242  transglycosylase-associated protein  43.42 
 
 
81 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  43.64 
 
 
82 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  43.64 
 
 
82 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  43.64 
 
 
82 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  43.64 
 
 
82 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  43.64 
 
 
82 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  43.64 
 
 
82 aa  49.3  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  43.64 
 
 
82 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  40.28 
 
 
86 aa  48.9  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  41.67 
 
 
84 aa  48.5  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4912  hypothetical protein  49.09 
 
 
87 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.59341  hitchhiker  0.00462659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5046  transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 
81 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4026  transglycosylase-associated protein  41.89 
 
 
84 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.846524  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5383  transglycosylase-associated protein  43.42 
 
 
81 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4484  transglycosylase-associated protein  41.89 
 
 
84 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.909812  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4503  Transglycosylase-associated protein  35.63 
 
 
88 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5492  hypothetical protein  44.44 
 
 
81 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  41.67 
 
 
84 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2260  hypothetical protein  39.34 
 
 
90 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880051  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0110  transglycosylase-associated protein  45.31 
 
 
97 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5334  transglycosylase-associated protein  58.14 
 
 
81 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5620  transglycosylase-associated protein  45.83 
 
 
81 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.969683  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1248  transglycosylase-associated protein  40.54 
 
 
84 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.251967  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0177  hypothetical protein  46.15 
 
 
102 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0261  transglycosylase-associated protein  38.46 
 
 
87 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  46.3 
 
 
88 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  45.45 
 
 
82 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  36.59 
 
 
90 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4202  Transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 
83 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0486  Transglycosylase-associated protein  35.29 
 
 
88 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1150  Transglycosylase-associated protein  33.33 
 
 
89 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000224941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  36.49 
 
 
99 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  35.23 
 
 
89 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2225  Transglycosylase-associated protein  38.18 
 
 
82 aa  47  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956968  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4021  transglycosylase-associated protein  34.48 
 
 
88 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.360585  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0140  transglycosylase-associated protein  43.06 
 
 
81 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4390  Transglycosylase-associated protein  34.48 
 
 
88 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.272942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4946  Transglycosylase-associated protein  34.48 
 
 
87 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177046  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  36.78 
 
 
86 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  36.84 
 
 
82 aa  46.2  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71590  hypothetical protein  47.17 
 
 
81 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6212  hypothetical protein  47.17 
 
 
81 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02247  transglycosylase-associated protein  38.57 
 
 
90 aa  45.4  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>