45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9244 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 90 aa  160  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  86.67 
 
 		 90 aa  138  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  69.77 
 
 		 88 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  54.44 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  65.91 
 
 		 88 aa  107  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  60.23 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  52.22 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  66.29 
 
 		 91 aa  97.4  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  56.18 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  57.14 
 
 		 102 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  57.14 
 
 		 102 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  57.14 
 
 		 102 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1048  hypothetical protein  53.41 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000383813  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3919  hypothetical protein  68.18 
 
 		 95 aa  87.4  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.121019 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  56.63 
 
 		 93 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0110  transglycosylase-associated protein  62.92 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3461  hypothetical protein  52.86 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2498  hypothetical protein  51.81 
 
 		 93 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.049765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  56.82 
 
 		 88 aa  77.8  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  55.17 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  62.5 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2260  hypothetical protein  49.43 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880051  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  45.57 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0966  hypothetical protein  62.69 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0503  transglycosylase-associated protein  67.8 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.83722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2545  putative signal peptide  47.62 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0056  integral membrane protein  50.68 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13836  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  41.86 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  58.33 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2571  hypothetical protein  44.58 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.725276  normal  0.146538 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  38.37 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  38.37 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  38.37 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1471  integral membrane protein  37.1 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  37.5 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  38.75 
 
 		 86 aa  47.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  45.9 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  41.25 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  29.07 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  45.76 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  39.66 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  42 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1872  hypothetical protein  46.15 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.03815  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2768  hypothetical protein  41.98 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111053  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>