44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3461 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3461  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  176  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  51.72 
 
 		 88 aa  93.6  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  50.57 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  47.73 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  52.27 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  43.68 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  46.43 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  46.59 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  49.45 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  45.45 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1048  hypothetical protein  46.81 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000383813  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  48.84 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  43.9 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  43.9 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  43.9 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2260  hypothetical protein  44.44 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880051  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0110  transglycosylase-associated protein  46.59 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  41.86 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  44.71 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  41.79 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2498  hypothetical protein  43.08 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.049765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  41.49 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3919  hypothetical protein  48.57 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.121019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2545  putative signal peptide  41.18 
 
 		 90 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0966  hypothetical protein  45.16 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2571  hypothetical protein  45.45 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.725276  normal  0.146538 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  51.92 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  37.04 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  36.47 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  34.09 
 
 		 223 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0503  transglycosylase-associated protein  41.38 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.83722 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  36.47 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  36.47 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  32.94 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  38.27 
 
 		 86 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0056  integral membrane protein  36.99 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13836  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  43.1 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  23.17 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2768  hypothetical protein  45.61 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111053  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  29.11 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  29.11 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  29.11 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  29.11 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  29.11 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>