35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2545 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2545  putative signal peptide  100 
 
 		 90 aa  169  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  61.18 
 
 		 99 aa  104  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2498  hypothetical protein  56.32 
 
 		 93 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.049765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  43.9 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  48.72 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  47.56 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  43.59 
 
 		 90 aa  67  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  44.3 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  48.1 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  49.18 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  43.04 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1471  integral membrane protein  41.54 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1048  hypothetical protein  41.67 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000383813  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3461  hypothetical protein  43.28 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  42.31 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  39.08 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2260  hypothetical protein  40 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880051  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  41.46 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3919  hypothetical protein  39.19 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.121019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  35 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  41.1 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  41.1 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  41.1 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  35.8 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0110  transglycosylase-associated protein  48.39 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  53.49 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  53.49 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  53.49 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  55.26 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0056  integral membrane protein  46.15 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13836  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  50 
 
 		 223 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  38.36 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1900  Transglycosylase-associated protein  32.22 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  34.88 
 
 		 88 aa  40.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0966  hypothetical protein  35.82 
 
 		 88 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>