48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0275 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0275  transmembrane region and signal peptide prediction  100 
 
 		 82 aa  154  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5231  transglycosylase-associated protein  42.31 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4705  transglycosylase-associated protein  39.74 
 
 		 83 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0185222 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4484  transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.909812  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4026  transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.846524  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1248  transglycosylase-associated protein  39.74 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.251967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2791  transglycosylase-associated protein  38.75 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3969  transglycosylase-associated protein  38.27 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709132  normal  0.0745804 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  37.66 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4202  Transglycosylase-associated protein  37.18 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01210  hypothetical protein  38.27 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0116  transglycosylase-associated protein  36.71 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4051  transglycosylase-associated protein  35.9 
 
 		 84 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220096  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5929  hypothetical protein  38.16 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5383  transglycosylase-associated protein  39.47 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5242  transglycosylase-associated protein  39.47 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5620  transglycosylase-associated protein  39.47 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.969683  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0140  transglycosylase-associated protein  38.16 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  35.06 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  35.06 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5334  transglycosylase-associated protein  38.16 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  35.06 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5046  transglycosylase-associated protein  37.66 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5492  hypothetical protein  37.66 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0177  hypothetical protein  37.66 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02247  transglycosylase-associated protein  45.95 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6212  hypothetical protein  48.84 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71590  hypothetical protein  48.84 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1793  Transglycosylase-associated protein  40.26 
 
 		 82 aa  43.5  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.899255  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1900  Transglycosylase-associated protein  37.84 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  32.94 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  32.94 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  32.94 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  39.44 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  39.44 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  39.44 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  36.36 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0977  Transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 89 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258897  normal  0.0607093 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  39.06 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3822  transglycosylase-associated protein  35 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0470364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  36.36 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3143  hypothetical protein  35.9 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.28458  normal  0.096168 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  31.76 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  34.12 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  34.18 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2936  Transglycosylase-associated protein  35.14 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>