106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2868 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2868  Transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 80 aa  140  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  54.43 
 
 		 79 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  59.49 
 
 		 80 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  55.7 
 
 		 79 aa  84.3  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  58.23 
 
 		 78 aa  84.3  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  54.43 
 
 		 80 aa  79.7  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  51.25 
 
 		 80 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  48.72 
 
 		 83 aa  73.9  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  48.75 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1208  transglycosylase-associated protein  62.03 
 
 		 79 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000243492  normal  0.0290476 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  51.25 
 
 		 84 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  51.25 
 
 		 84 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  49.37 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  49.37 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  48.1 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  48.1 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  50.67 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  48.1 
 
 		 83 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  48.1 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1911  transglycosylase-associated protein  46.15 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3461  transglycosylase-associated protein  44.87 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  43.59 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  48 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  43.59 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1988  transglycosylase-associated protein  53.16 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.928213  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  45.57 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0860  transglycosylase-associated protein  51.56 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0149  hypothetical protein  48.75 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1601  transglycosylase associated protein family  49.37 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2627  hypothetical protein  49.37 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2932  hypothetical protein  49.37 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2995  hypothetical protein  49.37 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.401136  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4121  transglycosylase-associated protein  51.9 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000759893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0997  hypothetical protein  49.33 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  53.45 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  48.1 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  48.1 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  44.3 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0730  Transglycosylase-associated protein  55.7 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1472  Transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3017  hypothetical protein  43.55 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6259  hypothetical protein  36.76 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0805  transglycosylase-associated protein  42.11 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3901  transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  41.89 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  40 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  46.43 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  46.43 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  41.89 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  39.47 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  46.43 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  46.43 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0123  transglycosylase-associated protein  40.28 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  35.9 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  35.9 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  38.36 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  45.78 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  40.74 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  45.24 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_004310  BR0433  transglycosylase-associated protein, putative  35 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0440  putative transglycosylase-associated protein  35 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  42.47 
 
 		 85 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  41.46 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3074  transglycosylase-associated protein  39.68 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  42.17 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  40 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  38.46 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  43.37 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  40.24 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0937  transglycosylase-associated protein  37.97 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.324449  normal  0.445038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  36.11 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  34.72 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  35 
 
 		 83 aa  42.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  43.37 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3529  transglycosylase-associated protein  34.62 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4169  transglycosylase-associated protein  37.31 
 
 		 82 aa  42  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  43.37 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  43.37 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  43.37 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  43.37 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4137  Transglycosylase-associated protein  40 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0915055  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  43.37 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3162  hypothetical protein  43.21 
 
 		 82 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00262305  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3146  hypothetical protein  43.21 
 
 		 82 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3056  hypothetical protein  43.21 
 
 		 82 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000292001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3411  hypothetical protein  43.21 
 
 		 82 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627369  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2221  transglycosylase-associated protein  38.98 
 
 		 89 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.024328  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 		 87 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3382  hypothetical protein  43.21 
 
 		 82 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0674128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3356  hypothetical protein  43.21 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3381  hypothetical protein  43.21 
 
 		 82 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2694  transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.975215  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  42.17 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3344  transglycosylase-associated protein  40.32 
 
 		 100 aa  40.8  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.121205 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  36.25 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2122  hypothetical protein  39.19 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1980  transglycosylase-associated protein  37.04 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4946  Transglycosylase-associated protein  36.99 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>