More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4809 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4809  transcriptional regulator  100 
 
 		 328 aa  655    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.763098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55250  transcriptional regulator  94.82 
 
 		 328 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000214379 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2505  LysR family transcriptional regulator  47.9 
 
 		 325 aa  269  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.646065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1167  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.12248  normal  0.176296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0036  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 322 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000369238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0050  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 322 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0050  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 322 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000844174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0053  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 322 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0674011 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0979  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  25 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2862  LysR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.486548  normal  0.303409 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  23 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0232  transcriptional regulator, LysR family  25.96 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0783  transcriptional regulator, LysR family  36.17 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0854  LysR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3855  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0669759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1158  LysR substrate-binding  24.37 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0562  LysR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00274587  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  21.9 
 
 		 293 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0854  LysR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  22.74 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  23 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 297 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  24.25 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2440  LysR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0826701  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1317  transcriptional regulator, LysR family  23.55 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5534  LysR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2716  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5774  LysR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2112  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.09 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000406165  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  21.74 
 
 		 293 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1478  LysR family transcriptional regulator  21.36 
 
 		 287 aa  53.5  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5828  transcriptional regulator, LysR family  23.45 
 
 		 296 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 293 aa  53.1  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0579  LysR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 303 aa  53.1  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.0538028 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2378  transcriptional regulator, LysR family  36.9 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.550059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0126  LysR family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 287 aa  53.1  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5552  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 305 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5829  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 298 aa  53.1  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0302326  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5917  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 305 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  25.78 
 
 		 313 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6421  LysR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 305 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1199  LysR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 313 aa  52.8  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3551  LysR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6116  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 410 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3226  LysR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2337  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3755  LysR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.984554  normal  0.0106865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1231  transcriptional regulator, LysR family  34.68 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2422  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  24.68 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.727626  normal  0.292199 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1128  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0334  LysR family transcriptional regulator SinR  22.22 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.997611  normal  0.270233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2899  transcriptional regulator, LysR family  39.13 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0977536  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0342  LysR family transcriptional regulator SinR  22.22 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.140328 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0342  LysR-family transcriptional regulator SinR  22.22 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539422  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0335  LysR-family transcriptional regulator SinR  22.22 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1339  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3131  LysR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001136  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 307 aa  50.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4989  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1150  LysR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2971  LysR family substrate binding transcriptional regulator  28 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2784  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.551315 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0623  transcriptional regulator, LysR family  30.17 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 313 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06651  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4166  LysR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0767  transcriptional regulator, LysR family  30.17 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1401  transcriptional regulator, LysR family  29.17 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.025944 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1336  transcriptional regulator, LysR family  29.17 
 
 		 297 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.916876  normal  0.272272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4901  LysR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 303 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.795056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01514  transcriptional regulatory protein  21.86 
 
 		 289 aa  50.1  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3426  LysR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 299 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2522  transcriptional regulator, LysR family  25.68 
 
 		 295 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  25.78 
 
 		 313 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3189  LysR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 302 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.77747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0572  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 297 aa  49.7  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0935642  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0444  LysR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 298 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.641872  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1113  LysR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 298 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379059  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1824  LysR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 298 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.381841  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2086  LysR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 298 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0350  LysR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 298 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0131  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3792  LysR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 296 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4938  LysR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0822  LysR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 298 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3222  LysR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002638  putative transcriptional regulator LysR family  36.99 
 
 		 316 aa  49.7  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0120713  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1224  carbonate dehydratase  36.99 
 
 		 313 aa  49.3  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000421173  normal  0.31799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3716  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 297 aa  49.3  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.264158 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1783  LysR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 298 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4782  LysR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 298 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.896768 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4702  transcriptional regulator, LysR family  26.5 
 
 		 305 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0005  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 299 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472408 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5963  transcriptional regulator, LysR family  24.58 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0185947 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3500  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.963487  normal  0.0497689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>