More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3026 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3026  shikimate transporter  100 
 
 		 440 aa  858    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.20137  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1246  General substrate transporter  41.79 
 
 		 440 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 445 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  36.01 
 
 		 431 aa  261  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  37.19 
 
 		 456 aa  259  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  37.82 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  36.93 
 
 		 461 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  37.91 
 
 		 434 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  37.83 
 
 		 445 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  37.24 
 
 		 445 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3284  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 445 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.41 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  37.16 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  36.65 
 
 		 443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  38.31 
 
 		 444 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 		 435 aa  253  5.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  38.06 
 
 		 444 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4580  major facilitator transporter  39.12 
 
 		 434 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 452 aa  252  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  36.02 
 
 		 446 aa  252  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  38.06 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 438 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 438 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.87 
 
 		 435 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  34.51 
 
 		 500 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  34.74 
 
 		 500 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  34.79 
 
 		 496 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  34.74 
 
 		 500 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 438 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 438 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  34.51 
 
 		 500 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  37.63 
 
 		 438 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0013  putative permease  33.1 
 
 		 446 aa  245  9e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  34.06 
 
 		 489 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  36.91 
 
 		 443 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  34.36 
 
 		 503 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  35.24 
 
 		 493 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  35.28 
 
 		 531 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  34.83 
 
 		 503 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  37 
 
 		 439 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  32.52 
 
 		 485 aa  243  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  32.52 
 
 		 485 aa  243  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1521  major facilitator family transporter  37.19 
 
 		 448 aa  241  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.537503  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  35.56 
 
 		 447 aa  242  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  32.27 
 
 		 485 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  32.03 
 
 		 485 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 467 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  32.03 
 
 		 485 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  32.03 
 
 		 485 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  32.03 
 
 		 485 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2381  general substrate transporter  36.76 
 
 		 439 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.841245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  32.03 
 
 		 485 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  33.99 
 
 		 441 aa  241  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 447 aa  240  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  34.79 
 
 		 489 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  34.79 
 
 		 489 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 489 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  31.78 
 
 		 485 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  36.97 
 
 		 436 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 441 aa  239  9e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  36.97 
 
 		 436 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  31.26 
 
 		 482 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1559  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 454 aa  238  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.956191  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  33.18 
 
 		 500 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  36.97 
 
 		 436 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1907  general substrate transporter  36.16 
 
 		 454 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522136  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  36.08 
 
 		 439 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 		 433 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 431 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  33.1 
 
 		 500 aa  237  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  34.55 
 
 		 489 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  32.34 
 
 		 500 aa  237  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2780  proline/glycine betaine transporter  35.1 
 
 		 501 aa  237  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01920  arabinose efflux permease family protein  34.23 
 
 		 449 aa  236  4e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.535895 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0763  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 422 aa  236  4e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000770218  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 436 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  32.93 
 
 		 500 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  32.93 
 
 		 500 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  32.93 
 
 		 500 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  32.93 
 
 		 500 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10171  putative proline/betaine transporter, MFS family protein  36.96 
 
 		 420 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.643051 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6814  major facilitator transporter  37.79 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  31.3 
 
 		 483 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1158  General substrate transporter  34.44 
 
 		 436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  32.86 
 
 		 500 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  32.86 
 
 		 500 aa  234  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  32.86 
 
 		 500 aa  234  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  34.79 
 
 		 496 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  32.86 
 
 		 500 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  32.86 
 
 		 500 aa  234  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3801  major facilitator family transporter  37.77 
 
 		 445 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  35.01 
 
 		 438 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  32.78 
 
 		 500 aa  233  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  32.78 
 
 		 500 aa  233  5e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  36.43 
 
 		 430 aa  233  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  35.51 
 
 		 495 aa  232  9e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1075  general substrate transporter  36.27 
 
 		 446 aa  232  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  33.41 
 
 		 500 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 450 aa  232  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>