More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_89481 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_89481  mitochondrial intermediate peptidase involved in protein import  100 
 
 
812 aa  1690    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.493678  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03660  mitochondrial intermediate peptidase, mitochondrial precursor, putative  35.47 
 
 
761 aa  417  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02140  metallopeptidase, putative  36.05 
 
 
715 aa  401  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0384968  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_24006  predicted protein  27.55 
 
 
749 aa  248  3e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_625  predicted protein  27.85 
 
 
657 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  26.83 
 
 
680 aa  195  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  26.09 
 
 
680 aa  194  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  26.09 
 
 
680 aa  194  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  26.09 
 
 
680 aa  194  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  26.23 
 
 
680 aa  194  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  25.95 
 
 
680 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  26.2 
 
 
680 aa  191  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  26.2 
 
 
680 aa  191  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  26.2 
 
 
680 aa  191  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  26.2 
 
 
680 aa  191  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  26.2 
 
 
680 aa  191  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  26.2 
 
 
680 aa  190  8e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  26.2 
 
 
680 aa  190  8e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  26.2 
 
 
680 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  26.06 
 
 
680 aa  188  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0010  oligopeptidase A  24.71 
 
 
680 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4196  oligopeptidase A  25.29 
 
 
680 aa  184  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  24.79 
 
 
680 aa  181  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1536  thimet oligopeptidase  24.27 
 
 
676 aa  178  4e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.100985  unclonable  4.6585e-19 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4479  oligopeptidase A  25.14 
 
 
680 aa  177  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  25.69 
 
 
680 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0090  oligopeptidase A  22.71 
 
 
692 aa  167  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0127  peptidyl-dipeptidase Dcp  24.65 
 
 
681 aa  167  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0425  Thimet oligopeptidase  23.75 
 
 
648 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0940  Peptidyl-dipeptidase Dcp  24.7 
 
 
696 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131573  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4545  peptidyl-dipeptidase Dcp  25.64 
 
 
694 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.757808 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  24.15 
 
 
682 aa  164  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0397  thimet oligopeptidase  23.75 
 
 
648 aa  163  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4180  thimet oligopeptidase  23.5 
 
 
644 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0858  peptidyl-dipeptidase Dcp  24.7 
 
 
696 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0111  oligopeptidase A  23.47 
 
 
695 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000602107 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0114  oligopeptidase A  23.49 
 
 
695 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.357976  normal  0.13234 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0054  oligopeptidase A  24.96 
 
 
695 aa  159  2e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0145  oligopeptidase A  23.9 
 
 
679 aa  159  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.491748  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0096  oligopeptidase A  23.33 
 
 
683 aa  158  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  hitchhiker  0.00599775 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  24.19 
 
 
680 aa  158  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0111  oligopeptidase A  23.33 
 
 
695 aa  158  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  23.52 
 
 
676 aa  157  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  23.82 
 
 
679 aa  157  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  24.05 
 
 
680 aa  157  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2026  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  23.46 
 
 
697 aa  157  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0253758  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  24.05 
 
 
682 aa  157  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1351  peptidyl-dipeptidase  24.39 
 
 
693 aa  156  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4839  peptidyl-dipeptidase Dcp  24.74 
 
 
696 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0948  oligopeptidase A  23.67 
 
 
690 aa  156  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.613607  normal  0.240038 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0791  oligopeptidase A  23.54 
 
 
679 aa  156  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  22.55 
 
 
683 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  23.67 
 
 
695 aa  155  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0426  Thimet oligopeptidase  23.17 
 
 
648 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  22.47 
 
 
683 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0124  oligopeptidase A  22.49 
 
 
679 aa  154  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  23.09 
 
 
679 aa  154  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  23.42 
 
 
681 aa  154  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  23.6 
 
 
680 aa  154  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3613  peptidyl-dipeptidase Dcp  25.88 
 
 
718 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000460509  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0212  oligopeptidase A  23.66 
 
 
683 aa  154  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51091  saccharolysin (oligopeptidase)  26.6 
 
 
658 aa  154  8.999999999999999e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0429  oligopeptidase A  24.44 
 
 
675 aa  153  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.735767  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0087  oligopeptidase A  24.32 
 
 
679 aa  152  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4256  oligopeptidase A  24.17 
 
 
679 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0006  Oligopeptidase A  25.2 
 
 
686 aa  152  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4699  oligopeptidase A  23.99 
 
 
679 aa  152  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3492  oligopeptidase A  24.46 
 
 
692 aa  152  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  0.378526 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1232  oligopeptidase A  23.5 
 
 
693 aa  152  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.966663  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  22.54 
 
 
694 aa  151  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  23.45 
 
 
709 aa  151  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4158  peptidyl-dipeptidase  25.16 
 
 
694 aa  150  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1228  Oligopeptidase A  23.32 
 
 
694 aa  150  8e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.470047  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3417  peptidyl-dipeptidase Dcp  24.22 
 
 
696 aa  150  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4392  oligopeptidase A  23.87 
 
 
679 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4217  Oligopeptidase A  23.87 
 
 
679 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0208  oligopeptidase A  25.28 
 
 
679 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1271  Oligopeptidase A  24.02 
 
 
671 aa  148  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5061  Thimet oligopeptidase  23.73 
 
 
655 aa  149  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28404  saccharolysin (oligopeptidase)  24.08 
 
 
687 aa  148  4.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  23.04 
 
 
680 aa  148  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  22.89 
 
 
678 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3842  oligopeptidase A  23.02 
 
 
679 aa  148  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05555  peptidyl-dipeptidase  25.74 
 
 
674 aa  147  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3177  peptidyl-dipeptidase Dcp  24.14 
 
 
687 aa  147  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  22.14 
 
 
682 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3935  oligopeptidase A  23.02 
 
 
679 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0122  oligopeptidase A  24.52 
 
 
680 aa  147  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  23.38 
 
 
679 aa  146  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1650  oligopeptidase A  23.53 
 
 
689 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48190  predicted protein  25.59 
 
 
780 aa  146  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1569  oligopeptidase A  23.53 
 
 
689 aa  146  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2397  oligopeptidase A  24.14 
 
 
685 aa  146  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  22.86 
 
 
681 aa  146  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4051  oligopeptidase A  23.42 
 
 
679 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0926  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  24.1 
 
 
692 aa  145  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0141  oligopeptidase A  23.53 
 
 
689 aa  145  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0166271  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03135  oligopeptidase A  23.79 
 
 
674 aa  145  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0124  oligopeptidase A  23.87 
 
 
679 aa  144  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3657  oligopeptidase A  24.48 
 
 
679 aa  144  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.601769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>