More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1569 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2159  oligopeptidase A  49.78 
 
 
695 aa  656    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1726  oligopeptidase A  49.64 
 
 
699 aa  675    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328644  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1298  oligopeptidase A  47.28 
 
 
692 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.757231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2750  oligopeptidase A  49.93 
 
 
699 aa  675    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0141  oligopeptidase A  99.27 
 
 
689 aa  1388    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0166271  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5447  oligopeptidase A  49.71 
 
 
695 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1232  oligopeptidase A  86 
 
 
693 aa  1196    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.966663  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1860  oligopeptidase A  50.58 
 
 
700 aa  686    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709239  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2235  oligopeptidase A  49.64 
 
 
699 aa  675    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1129  oligopeptidase A  50.15 
 
 
695 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60188  normal  0.628312 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1476  oligopeptidase A  50.58 
 
 
704 aa  686    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0816638  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1507  oligopeptidase A  49.64 
 
 
699 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1534  oligopeptidase A  49.71 
 
 
716 aa  677    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2674  oligopeptidase A  49.78 
 
 
699 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1569  oligopeptidase A  100 
 
 
689 aa  1397    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2051  oligopeptidase A  49.56 
 
 
695 aa  656    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347537  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5936  oligopeptidase A  49.64 
 
 
695 aa  655    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00788443  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3084  oligopeptidase A  49.64 
 
 
699 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2597  Oligopeptidase A  49.71 
 
 
702 aa  659    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219931  normal  0.0217228 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1650  oligopeptidase A  99.27 
 
 
689 aa  1388    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2178  oligopeptidase A  49.56 
 
 
695 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.61297  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2141  oligopeptidase A  49.64 
 
 
695 aa  655    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388715  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2618  oligopeptidase A  49.64 
 
 
699 aa  675    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1623  Oligopeptidase A  46.85 
 
 
704 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.932062 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1951  Oligopeptidase A  46.85 
 
 
704 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844627  normal  0.0899993 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1595  oligopeptidase A  47.51 
 
 
706 aa  628  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1191  oligopeptidase A  46.52 
 
 
700 aa  614  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00600265  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0150  oligopeptidase A  44.35 
 
 
679 aa  589  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0372443 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3646  oligopeptidase A  44.9 
 
 
684 aa  568  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2433  oligopeptidase A  45.89 
 
 
701 aa  569  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1481  Oligopeptidase A  45.88 
 
 
714 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2614  oligopeptidase A  44.8 
 
 
685 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2483  oligopeptidase A  43.1 
 
 
703 aa  561  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3984  oligopeptidase A  45.78 
 
 
682 aa  561  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199844  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0702  Oligopeptidase A  41.47 
 
 
712 aa  553  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.713847  normal  0.266777 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2132  oligopeptidase A  44.9 
 
 
677 aa  546  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0694294  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2855  oligopeptidase A  44.67 
 
 
687 aa  545  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2129  oligopeptidase A  45.23 
 
 
677 aa  543  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.228019 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0730  oligopeptidase A  41.65 
 
 
708 aa  544  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1653  Oligopeptidase A  45.23 
 
 
677 aa  544  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2458  oligopeptidase A  45.51 
 
 
679 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105429  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2208  oligopeptidase A  43.5 
 
 
679 aa  532  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696851  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2158  Oligopeptidase A  43.8 
 
 
685 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  42.79 
 
 
694 aa  531  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1923  oligopeptidase A  43.57 
 
 
679 aa  525  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0492523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1642  oligopeptidase A  44.33 
 
 
676 aa  526  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0006  Oligopeptidase A  41.8 
 
 
682 aa  523  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322163  normal  0.727066 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03135  oligopeptidase A  43.94 
 
 
674 aa  523  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0006  Oligopeptidase A  41.61 
 
 
686 aa  524  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  38.46 
 
 
683 aa  521  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0031  oligopeptidase A  40.58 
 
 
685 aa  521  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  40.12 
 
 
681 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  38.93 
 
 
683 aa  518  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3493  Oligopeptidase A  44.25 
 
 
676 aa  513  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.161675  normal  0.315797 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0089  oligopeptidase A  42.75 
 
 
674 aa  513  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0104  oligopeptidase A  42.46 
 
 
674 aa  510  1e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  38.57 
 
 
676 aa  509  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  38.57 
 
 
680 aa  509  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0791  oligopeptidase A  38.72 
 
 
679 aa  509  1e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  37.76 
 
 
680 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  39.01 
 
 
680 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4699  oligopeptidase A  40.78 
 
 
679 aa  504  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  39.01 
 
 
680 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  39.45 
 
 
680 aa  503  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4256  oligopeptidase A  40.55 
 
 
679 aa  505  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  39.01 
 
 
680 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  39.01 
 
 
680 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4392  oligopeptidase A  40.26 
 
 
679 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3842  oligopeptidase A  40.32 
 
 
679 aa  505  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  39.39 
 
 
679 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3935  oligopeptidase A  40.32 
 
 
679 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  39.88 
 
 
682 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4051  oligopeptidase A  40.32 
 
 
679 aa  503  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  39.01 
 
 
680 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0124  oligopeptidase A  39.83 
 
 
679 aa  501  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  40.82 
 
 
683 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0145  oligopeptidase A  39.39 
 
 
679 aa  501  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.491748  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  39.16 
 
 
680 aa  499  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  37.7 
 
 
680 aa  501  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4217  Oligopeptidase A  40.26 
 
 
679 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  39.74 
 
 
678 aa  501  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  39.59 
 
 
680 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  40.15 
 
 
682 aa  497  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  39.59 
 
 
680 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0156  oligopeptidase A  38.55 
 
 
683 aa  498  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0141  oligopeptidase A  39 
 
 
685 aa  497  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  40.38 
 
 
683 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  39.59 
 
 
680 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  39.59 
 
 
680 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  39.59 
 
 
680 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  39.59 
 
 
680 aa  496  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0087  oligopeptidase A  40.58 
 
 
679 aa  496  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  37.25 
 
 
695 aa  498  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0124  oligopeptidase A  40.12 
 
 
679 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  39.45 
 
 
680 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  39.36 
 
 
679 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  39.59 
 
 
680 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  38.72 
 
 
679 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  41.48 
 
 
681 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3657  oligopeptidase A  39.3 
 
 
679 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.601769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>