More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_67671 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_67671  predicted protein  100 
 
 
341 aa  704    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0129637  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86463  predicted protein  48.35 
 
 
334 aa  318  7.999999999999999e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08603  conserved hypothetical protein  31.87 
 
 
417 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10514  short-chain dehydrogenase/reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02770)  30.98 
 
 
349 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02813  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G04560)  39.18 
 
 
268 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000285176  normal  0.115904 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
301 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03305  short chain dehydrogenase/reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14310)  29.1 
 
 
331 aa  106  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.48 
 
 
292 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
303 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38463  predicted protein  29.5 
 
 
342 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622688  normal  0.36197 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 
316 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  30.24 
 
 
305 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  34.17 
 
 
309 aa  99.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  33.75 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05270  AY086643 putativepod-specific dehydrogenase SAC25, putative  33.08 
 
 
364 aa  97.4  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
312 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  33.33 
 
 
309 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.84 
 
 
292 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
324 aa  95.9  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  33.04 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  28.4 
 
 
300 aa  95.5  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  31.95 
 
 
304 aa  94.4  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.18 
 
 
319 aa  94.4  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  31.38 
 
 
301 aa  93.2  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10815  conserved hypothetical protein  36.97 
 
 
323 aa  92.4  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  31.69 
 
 
284 aa  92  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.3 
 
 
298 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  27.65 
 
 
306 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.53 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07339  conserved hypothetical protein  34.91 
 
 
359 aa  90.9  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.201379  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  29.75 
 
 
303 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  31.43 
 
 
309 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  27.35 
 
 
306 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  27.35 
 
 
306 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.49 
 
 
333 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.98 
 
 
320 aa  90.1  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  28.1 
 
 
317 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.14 
 
 
322 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.9 
 
 
320 aa  90.1  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.06 
 
 
315 aa  90.1  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  31.45 
 
 
311 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 
326 aa  89  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
326 aa  89  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  28.31 
 
 
311 aa  89  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  34.31 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.71 
 
 
332 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 
304 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81469  short-chain alcohol dehydrogenase retinol dehydrogenase Protochlorophyllide reductase  30.62 
 
 
334 aa  88.2  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.761909  normal  0.570556 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  29.52 
 
 
305 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  31.38 
 
 
320 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 
325 aa  86.7  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  27.25 
 
 
303 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.08 
 
 
340 aa  86.3  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00109277  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 
288 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  30.51 
 
 
308 aa  86.3  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.26 
 
 
307 aa  85.9  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  29.57 
 
 
329 aa  85.9  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  28.33 
 
 
737 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36252  predicted protein  26.54 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140786  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.45 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.28 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.45 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.45 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  30.51 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  27.84 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  30.77 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  28.18 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  28.18 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 
324 aa  82  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  27.51 
 
 
292 aa  82.4  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 
317 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 
325 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  26.67 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29666  short-chain alcohol dehydrogenase  27.87 
 
 
338 aa  82  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.62197 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.51 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.37 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  29.32 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
340 aa  79.7  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.76 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  28.35 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.27 
 
 
331 aa  79.3  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.36 
 
 
331 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.45 
 
 
341 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  32.7 
 
 
661 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.05 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10208  probable oxidoreductase  25.65 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.94 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.35 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.25 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108282  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>