More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_86463 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_86463  predicted protein  100 
 
 
334 aa  687    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67671  predicted protein  48.35 
 
 
341 aa  317  2e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0129637  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10514  short-chain dehydrogenase/reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02770)  33.64 
 
 
349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08603  conserved hypothetical protein  33.12 
 
 
417 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  31.45 
 
 
309 aa  122  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02813  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G04560)  35.11 
 
 
268 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000285176  normal  0.115904 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  32.1 
 
 
311 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 
305 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05270  AY086643 putativepod-specific dehydrogenase SAC25, putative  31.9 
 
 
364 aa  116  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.49 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  30.69 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.59 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.04 
 
 
307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  30.5 
 
 
309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  29.58 
 
 
316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.66 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  30.6 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36252  predicted protein  29.52 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140786  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.94 
 
 
312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  30.28 
 
 
309 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 
303 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 
312 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.34 
 
 
324 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  31.25 
 
 
292 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 
277 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  34.58 
 
 
324 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.88 
 
 
288 aa  106  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  30.56 
 
 
303 aa  106  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  33.63 
 
 
302 aa  105  8e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.88 
 
 
289 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.88 
 
 
289 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.88 
 
 
289 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.97 
 
 
324 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.59 
 
 
304 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 
320 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  32.41 
 
 
305 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
305 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  hitchhiker  0.00451656 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  30.42 
 
 
300 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  30.42 
 
 
300 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.56 
 
 
317 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 
320 aa  102  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  29.82 
 
 
300 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
327 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
333 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.87 
 
 
292 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
325 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.74 
 
 
307 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
326 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  32.51 
 
 
661 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.75 
 
 
297 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.34 
 
 
339 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
315 aa  99.8  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.08 
 
 
303 aa  99.4  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.61 
 
 
323 aa  98.6  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.48 
 
 
340 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  31.75 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  32.43 
 
 
305 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  33.94 
 
 
300 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35460  predicted protein  37.72 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.13 
 
 
298 aa  97.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.14 
 
 
326 aa  97.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.59 
 
 
298 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  30.74 
 
 
311 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  33.03 
 
 
308 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  29.49 
 
 
306 aa  96.3  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
341 aa  96.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07339  conserved hypothetical protein  33.62 
 
 
359 aa  96.3  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.201379  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  32.76 
 
 
284 aa  95.9  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.85 
 
 
332 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5484  predicted protein  32 
 
 
206 aa  95.5  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0315179  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 
322 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.23 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.89 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  32.08 
 
 
306 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30578  predicted protein  28.71 
 
 
352 aa  94.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.81 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  32.08 
 
 
306 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10815  conserved hypothetical protein  32.6 
 
 
323 aa  94  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.48 
 
 
287 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
328 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.49 
 
 
298 aa  93.6  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.1 
 
 
318 aa  93.6  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  27.74 
 
 
317 aa  94  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81469  short-chain alcohol dehydrogenase retinol dehydrogenase Protochlorophyllide reductase  28.4 
 
 
334 aa  93.6  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.761909  normal  0.570556 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.86 
 
 
271 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196171  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.7 
 
 
324 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  31.56 
 
 
320 aa  92.8  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03226  conserved hypothetical protein  28.39 
 
 
312 aa  92.8  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  29.57 
 
 
301 aa  92.4  8e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  28.76 
 
 
304 aa  92.4  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03305  short chain dehydrogenase/reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14310)  30.19 
 
 
331 aa  92  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.63 
 
 
288 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 
331 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 
331 aa  92  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29 
 
 
307 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.86 
 
 
341 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  31.74 
 
 
306 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>