More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14962 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_14962  cystathionine beta-lyase  100 
 
 		 400 aa  816    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0184  Cystathionine gamma-synthase  45.82 
 
 		 378 aa  280  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  42.3 
 
 		 376 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  42.35 
 
 		 372 aa  272  9e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1055  cystathionine gamma-synthase  43.85 
 
 		 380 aa  269  8e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1876  Cystathionine gamma-lyase  40.21 
 
 		 371 aa  261  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4016  cystathionine gamma-synthase  40.66 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.683871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1506  Cystathionine gamma-synthase  40.37 
 
 		 373 aa  255  8e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3084  Cystathionine gamma-synthase  41.55 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.644471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0780  cystathionine gamma-synthase  41.62 
 
 		 379 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4330  hypothetical protein  41.62 
 
 		 379 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  38.3 
 
 		 387 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1685  Cystathionine gamma-synthase  37.83 
 
 		 378 aa  236  4e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00806009  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  38.6 
 
 		 390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2858  cystathionine gamma-synthase  41.55 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  37.38 
 
 		 390 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  37.69 
 
 		 398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  34.75 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  36.68 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  35.8 
 
 		 392 aa  226  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  36.75 
 
 		 378 aa  226  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  36.16 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  37.19 
 
 		 392 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  36.57 
 
 		 401 aa  226  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  37.19 
 
 		 392 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  37.19 
 
 		 392 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  36.95 
 
 		 378 aa  226  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  39.68 
 
 		 390 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  38.12 
 
 		 381 aa  226  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  39.42 
 
 		 390 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  35.34 
 
 		 380 aa  225  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  38.96 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  37.96 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  33.98 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  37.16 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  38.89 
 
 		 390 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  38.02 
 
 		 387 aa  224  3e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  37.98 
 
 		 387 aa  223  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  37.11 
 
 		 379 aa  224  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  35.9 
 
 		 392 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  36.96 
 
 		 388 aa  223  6e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2976  Cystathionine gamma-synthase  39.84 
 
 		 417 aa  223  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0165  cystathionine beta-lyase  35.11 
 
 		 384 aa  223  6e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  32.83 
 
 		 392 aa  222  8e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  38.16 
 
 		 388 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.78 
 
 		 387 aa  222  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  36.25 
 
 		 389 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  38.67 
 
 		 383 aa  222  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  37.18 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  36.21 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  36.41 
 
 		 381 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0913  cystathionine gamma-synthase  37.64 
 
 		 394 aa  219  6e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.646097  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  36.18 
 
 		 380 aa  219  6e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88245  cystathione beta lyase  35.73 
 
 		 404 aa  219  7e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0106634  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  35.81 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  37.78 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  36.22 
 
 		 393 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  36.91 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0169  cystathionine beta-lyase  34.61 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  36.18 
 
 		 379 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  37.08 
 
 		 392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  33.58 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  35.56 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0937  Cystathionine gamma-synthase  37.25 
 
 		 411 aa  216  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  36.9 
 
 		 387 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  35.81 
 
 		 389 aa  216  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  36.62 
 
 		 387 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0718  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  36.62 
 
 		 394 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  35.56 
 
 		 397 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1618  Cystathionine gamma-synthase  37.1 
 
 		 383 aa  216  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  35.77 
 
 		 378 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  35.22 
 
 		 397 aa  216  7e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1549  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  39.3 
 
 		 377 aa  215  9e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0429741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  37.16 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1031  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  39.04 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  34.09 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  36.29 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  36.39 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  35.82 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  34.81 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  40.85 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  35.53 
 
 		 376 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3903  cystathionine gamma-lyase  34.47 
 
 		 390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  36.73 
 
 		 400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  35.98 
 
 		 388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1446  Cystathionine gamma-lyase  38.82 
 
 		 382 aa  213  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.819865  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  35.7 
 
 		 387 aa  213  7e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  36.6 
 
 		 386 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  35.06 
 
 		 397 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  33.98 
 
 		 413 aa  212  9e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  35.14 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2638  Cystathionine gamma-synthase  37.88 
 
 		 406 aa  212  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  36.11 
 
 		 380 aa  212  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  34.99 
 
 		 386 aa  212  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  33.85 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  36.65 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  36.1 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  35.82 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  35.57 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  35.82 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>