More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2837 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2837  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 398 aa  791    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5878  major facilitator transporter  49.61 
 
 		 390 aa  310  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0775093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0909  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0668  MFS transporter  27.85 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1077  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 403 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4363  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1348  arabinose efflux permease  24.79 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0715454  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0914  MFS transporter  23.28 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  22.8 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  21.35 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4819  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 489 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1090  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0155468 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24770  arabinose efflux permease family protein  27.34 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3163  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5135  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5205  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5072  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3292  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23550  arabinose efflux permease family protein  28.8 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.655191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3614  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  31.65 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  27.88 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  24.51 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06496  hypothetical protein  25.1 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1561  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  26.24 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  28.32 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  28.32 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2354  MFS transporter  29.71 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  28.9 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1550  major facilitator superfamily transporter  30.56 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464954 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  28.32 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21230  catecholate siderophore efflux pump, MFS_1 family  27.17 
 
 		 407 aa  57  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000768503  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  23.08 
 
 		 526 aa  57  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  28.9 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  32 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  28.06 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  26.85 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3090  major facilitator transporter  25 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.052943 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  30.06 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  25.86 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  21.49 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  22.62 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  25 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 400 aa  55.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23780  arabinose efflux permease family protein  23.78 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  26.13 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  27.36 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  23.02 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  23.02 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  23.02 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  23.02 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  23.02 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1598  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 403 aa  54.3  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.665811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  24.75 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3400  tranporter transmembrane protein  26.97 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  26.47 
 
 		 400 aa  53.9  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1862  multidrug resistance protein  19.72 
 
 		 391 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  19.79 
 
 		 398 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 392 aa  54.3  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2004  multidrug resistance protein  19.72 
 
 		 391 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627866  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  27.34 
 
 		 396 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  24.05 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 456 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 399 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3694  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 411 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0166354  normal  0.86684 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  24.86 
 
 		 394 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  23.7 
 
 		 415 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 415 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 392 aa  53.5  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  26 
 
 		 438 aa  53.5  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  23.7 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  31.76 
 
 		 452 aa  53.5  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03150  arabinose efflux permease family protein  27.14 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 437 aa  53.1  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  26.49 
 
 		 451 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 391 aa  53.1  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  24.86 
 
 		 404 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 452 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  26.49 
 
 		 451 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  26 
 
 		 438 aa  53.1  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1603  major facilitator transporter  21.76 
 
 		 386 aa  53.1  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000182217  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>