More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2912 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2912  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 293 aa  600  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1546  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000827637  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2431  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  23.79 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.690566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2291  transcriptional regulator, AraC family  23.05 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51400  transcriptional regulator AraC family  26.78 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7100  transcriptional regulator, AraC family  26.25 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723966  normal  0.268951 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1012  transcriptional regulator, AraC family  22.76 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  25.94 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1378  AraC family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0818  AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  28.83 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37180  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  26.89 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0423  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  22.18 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3869  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.36 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  22.08 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2723  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4772  AraC family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6330  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.361086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18110  transcriptional regulator MmsR  25.21 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  30.93 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2830  helix-turn-helix domain-containing protein  37.35 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3518  transcriptional regulator, AraC family  25.1 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.630647 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2995  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 341 aa  57  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1506  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570084  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6323  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1573  transcriptional regulator MmsR  25.21 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0954  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6981  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0671274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  36.59 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000994716  hitchhiker  0.0000611237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3295  transcriptional regulator, AraC family  32.46 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 330 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1743  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 501 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.32779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54610  putative transcriptional regulator  25.5 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53981  normal  0.0153543 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2677  transcriptional regulator, AraC family  26.2 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3439  AraC family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3229  transcriptional regulator, AraC family  30.61 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.686696 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  34.15 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  34.15 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 334 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  34.15 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2167  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5544  transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 		 463 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258636  normal  0.142482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  34.15 
 
 		 332 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 255 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.36 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3875  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 457 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.740536  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  22.89 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  24.58 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  33.75 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  23.01 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 349 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  27.1 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3418  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 97 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0768  AraC family transcriptional regulator  21.58 
 
 		 261 aa  53.5  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 335 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3041  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1007  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 287 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  32.82 
 
 		 333 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 364 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  34.15 
 
 		 255 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1299  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 285 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.736083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0974  helix-turn-helix domain-containing protein  35.37 
 
 		 314 aa  53.1  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3063  helix-turn-helix domain-containing protein  35.19 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 255 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  33.59 
 
 		 333 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 325 aa  53.1  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 255 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 299 aa  52.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>