More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2340 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2340  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
295 aa  597  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.505154  hitchhiker  0.00888512 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3533  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 
272 aa  102  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  28.36 
 
 
205 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  34.29 
 
 
211 aa  75.5  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  29.86 
 
 
214 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  29.56 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  27.88 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  27.4 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  25.93 
 
 
209 aa  67  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  28.17 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  26.7 
 
 
237 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 
214 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 
214 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  27.23 
 
 
213 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  27.62 
 
 
195 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1587  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.57 
 
 
255 aa  63.5  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.325978  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4261  beta-lactamase domain protein  31.29 
 
 
369 aa  62.4  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  23.65 
 
 
206 aa  62.4  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  29.49 
 
 
204 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  26.95 
 
 
212 aa  61.2  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  28.99 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  26.7 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  23.15 
 
 
206 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 
210 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 
212 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  25.37 
 
 
212 aa  61.6  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  30.88 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  24.88 
 
 
198 aa  60.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.7 
 
 
214 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  34.29 
 
 
209 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  27.93 
 
 
213 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  25.12 
 
 
205 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0912  beta-lactamase domain protein  25.37 
 
 
200 aa  60.5  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.330922  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  26.39 
 
 
231 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 
214 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0463  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 
192 aa  60.1  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00512512  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 
214 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  26.7 
 
 
214 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  26.18 
 
 
214 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  26.7 
 
 
214 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
209 aa  60.1  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  27.49 
 
 
574 aa  60.1  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2884  beta-lactamase domain protein  29.12 
 
 
191 aa  59.3  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 
210 aa  59.3  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  26.18 
 
 
214 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  26.18 
 
 
214 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  26.18 
 
 
214 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  24.41 
 
 
217 aa  59.3  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 
207 aa  59.3  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  26.18 
 
 
214 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  26.18 
 
 
214 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  31.48 
 
 
244 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2513  beta-lactamase domain protein  28.89 
 
 
192 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  30.71 
 
 
463 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1819  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 
204 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368429  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  23.44 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.05 
 
 
243 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  28.91 
 
 
231 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  24.42 
 
 
467 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15170  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.94 
 
 
226 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.112325 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  32.34 
 
 
251 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.63 
 
 
222 aa  57.4  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  32.26 
 
 
218 aa  57  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  26.73 
 
 
222 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.26 
 
 
216 aa  57  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  26.73 
 
 
222 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  26.73 
 
 
222 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 
222 aa  56.6  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 
208 aa  56.6  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3167  beta-lactamase domain protein  25.69 
 
 
231 aa  56.6  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0163096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  26.51 
 
 
231 aa  56.6  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  23.56 
 
 
213 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  27.93 
 
 
225 aa  56.2  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  22.33 
 
 
214 aa  56.2  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  26.61 
 
 
256 aa  55.8  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3119  beta-lactamase domain-containing protein  26.04 
 
 
216 aa  55.8  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603346  normal  0.30493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  30.07 
 
 
242 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.88 
 
 
215 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  26.92 
 
 
216 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.88 
 
 
215 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  29.46 
 
 
209 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  27.85 
 
 
234 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.88 
 
 
215 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0374  beta-lactamase-like  24.61 
 
 
222 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.834872 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4317  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.11 
 
 
214 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.88 
 
 
215 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.38 
 
 
215 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  26.95 
 
 
214 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.88 
 
 
215 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0402  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 
214 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  25.4 
 
 
215 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  25.4 
 
 
215 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  26.88 
 
 
226 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  28.48 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1282  rhodanese-like protein  28.09 
 
 
397 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0243  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
215 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  28.4 
 
 
222 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  26.6 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  27.38 
 
 
212 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  26.79 
 
 
215 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>