More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3533 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3533  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
272 aa  551  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  35.32 
 
 
209 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2340  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 
295 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.505154  hitchhiker  0.00888512 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  31.68 
 
 
210 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 
215 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  32.66 
 
 
210 aa  99  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  31.82 
 
 
214 aa  98.2  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  28.84 
 
 
205 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 
209 aa  96.3  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  31.03 
 
 
217 aa  96.3  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
251 aa  96.3  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 
210 aa  95.5  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 
209 aa  95.9  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  29.95 
 
 
215 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  29.44 
 
 
215 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 
215 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  29.44 
 
 
215 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  29.95 
 
 
215 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
213 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  28.71 
 
 
209 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 
207 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  29.35 
 
 
209 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 
215 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 
215 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 
215 aa  93.2  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 
215 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  31.03 
 
 
205 aa  92.8  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  30.35 
 
 
205 aa  92.4  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1997  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  36.07 
 
 
215 aa  92.4  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  29.08 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 
215 aa  91.3  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0246  beta-lactamase domain protein  34.07 
 
 
213 aa  90.1  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  29 
 
 
213 aa  90.5  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  28.71 
 
 
207 aa  90.5  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
214 aa  89.4  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  31.84 
 
 
214 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  31.84 
 
 
214 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  31.84 
 
 
214 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  30.15 
 
 
215 aa  89  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  31.84 
 
 
214 aa  89  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  31.84 
 
 
214 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  34.83 
 
 
210 aa  88.6  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.34 
 
 
214 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  28.93 
 
 
215 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 
215 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  31.34 
 
 
214 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  28.79 
 
 
212 aa  87.8  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.43 
 
 
215 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.43 
 
 
215 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  29.06 
 
 
207 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.43 
 
 
215 aa  87.4  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.43 
 
 
215 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.43 
 
 
215 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  29.35 
 
 
213 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.43 
 
 
215 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  31.07 
 
 
214 aa  87  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  31.47 
 
 
210 aa  87  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  31.18 
 
 
213 aa  86.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 
215 aa  86.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  31 
 
 
214 aa  86.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
214 aa  86.3  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 
215 aa  85.9  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 
211 aa  85.9  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 
235 aa  85.5  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  32.16 
 
 
214 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 
214 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 
205 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  28.08 
 
 
211 aa  85.1  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  30.05 
 
 
206 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  28.43 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  27.86 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 
214 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  29.02 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  26.77 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2720  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.373354  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  30.85 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  32.2 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.29 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  28.14 
 
 
215 aa  82  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 
195 aa  82  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 
210 aa  82  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 
210 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  30.5 
 
 
216 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  28.33 
 
 
218 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  26.13 
 
 
209 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 
214 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0179  beta-lactamase domain-containing protein  31.46 
 
 
213 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  26.37 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 
214 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  28.86 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  27.5 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  28.02 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  29.02 
 
 
206 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  26.24 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  30.54 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  27.5 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>