100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0394 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 322 aa  650    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  51.24 
 
 		 331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2046  radical SAM domain-containing protein  50.77 
 
 		 331 aa  300  2e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  49.23 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1662  radical SAM family Fe-S protein  46.6 
 
 		 327 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  46.6 
 
 		 330 aa  265  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  44.19 
 
 		 314 aa  219  5e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2140  Radical SAM domain protein  46.37 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  41.3 
 
 		 322 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  39.32 
 
 		 343 aa  212  7e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1803  radical SAM family protein  41.28 
 
 		 321 aa  208  8e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  27.84 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.25 
 
 		 362 aa  82.4  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2060  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  30.42 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  29.76 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2885  Radical SAM domain protein  27.35 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806461  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  26.19 
 
 		 359 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  25.79 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  28.64 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0775  radical SAM domain-containing protein  23.88 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  26.51 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.67 
 
 		 365 aa  65.9  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  26.38 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  25.4 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  26 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0912  radical SAM domain-containing protein  22.7 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  21.88 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  22.55 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2001  radical SAM domain-containing protein  26.48 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.84 
 
 		 356 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0919  Radical SAM domain protein  26.91 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000116556  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  24.77 
 
 		 366 aa  53.1  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0196  hypothetical protein  29.55 
 
 		 401 aa  52.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2747  hypothetical protein  29.55 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  23.01 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  22.13 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  28.51 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0963  hypothetical protein  23.95 
 
 		 380 aa  50.8  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0033  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 296 aa  49.7  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.531209  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2257  radical SAM family Fe-S protein  24.1 
 
 		 446 aa  49.7  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.452543  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0705  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 		 283 aa  49.3  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0826  radical SAM family protein  28.24 
 
 		 422 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.243039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1787  radical SAM domain-containing protein  29 
 
 		 422 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1759  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.26 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  28.49 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  27.49 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0353  hypothetical protein  28.15 
 
 		 466 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  25.86 
 
 		 361 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1520  Radical SAM domain protein  22.16 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0681  radical SAM domain-containing protein  26.03 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0270  hypothetical protein  27.27 
 
 		 405 aa  47  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.901692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0306  hypothetical protein  26.61 
 
 		 418 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0825598  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  26.92 
 
 		 321 aa  46.2  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  30.15 
 
 		 349 aa  46.2  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2639  hypothetical protein  26.83 
 
 		 417 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20010  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.29 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0117672 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  26.77 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  27.84 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4056  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 418 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0464079 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0626  RNA modification enzyme, MiaB family  25.78 
 
 		 439 aa  45.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.196268  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2231  biotin synthase  28.25 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0146  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  47.62 
 
 		 438 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00677283  normal  0.468317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1202  Radical SAM domain protein  23.28 
 
 		 418 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000160208  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  24.17 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0246  hypothetical protein  25.87 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2337  hypothetical protein  27.07 
 
 		 458 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.587976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  25 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0106  hypothetical protein  30 
 
 		 471 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  24.84 
 
 		 345 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  27.34 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  27.56 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  24.71 
 
 		 361 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  23.41 
 
 		 370 aa  43.9  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  24.71 
 
 		 361 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  27.56 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  29.14 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5825  hypothetical protein  20.36 
 
 		 433 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3415  biotin synthase  25.6 
 
 		 374 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371377  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12078  hypothetical protein  28.85 
 
 		 420 aa  43.5  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01181  Fe-S oxidoreductase  29 
 
 		 454 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.681569  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  22.67 
 
 		 351 aa  43.5  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1498  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  22.58 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.286832  normal  0.0117341 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01171  Fe-S oxidoreductase  29 
 
 		 454 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.72418  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01141  Fe-S oxidoreductase  33.78 
 
 		 454 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1426  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.54 
 
 		 322 aa  43.1  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  28.05 
 
 		 370 aa  42.7  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  25.78 
 
 		 360 aa  42.7  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0228  hypothetical protein  27 
 
 		 417 aa  42.7  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008996 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0124  radical SAM family protein  29.29 
 
 		 431 aa  42.7  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0282893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  29.89 
 
 		 328 aa  42.7  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0347  hypothetical protein  27.21 
 
 		 420 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0668  Radical SAM domain protein  26.21 
 
 		 419 aa  42.4  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.332892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>