62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0033 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0033  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.531209  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0962  radical SAM domain-containing protein  47.22 
 
 		 290 aa  275  5e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0681  radical SAM domain-containing protein  49.29 
 
 		 283 aa  267  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0705  radical SAM domain-containing protein  47.7 
 
 		 283 aa  259  3e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0912  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1520  Radical SAM domain protein  37.25 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0919  Radical SAM domain protein  33.9 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000116556  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  32.31 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0592  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 		 371 aa  114  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000649486  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  28.01 
 
 		 349 aa  112  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2088  Radical SAM domain protein  27.24 
 
 		 351 aa  112  5e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1558  radical SAM domain-containing protein  25.31 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0417812 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2171  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00159358  decreased coverage  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2543  radical SAM domain protein  25 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  25.27 
 
 		 383 aa  92.8  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2140  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  29.17 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  26.35 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  26.32 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  25.37 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  25.44 
 
 		 356 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  26.05 
 
 		 359 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 370 aa  53.5  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  26.61 
 
 		 360 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 322 aa  52.8  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.59 
 
 		 362 aa  52.4  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  23.88 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  24.62 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  26.57 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 		 362 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  25.79 
 
 		 341 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  23.79 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  27.86 
 
 		 490 aa  49.7  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  25.16 
 
 		 341 aa  49.7  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  23.87 
 
 		 334 aa  49.3  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  24 
 
 		 330 aa  49.3  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  22.96 
 
 		 379 aa  48.9  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25 
 
 		 365 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  23.64 
 
 		 371 aa  47.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  22.94 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  22.94 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 		 367 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  22.69 
 
 		 335 aa  46.2  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  22.69 
 
 		 335 aa  46.2  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3370  lipoic acid synthetase  24.47 
 
 		 324 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  21.93 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  22.02 
 
 		 367 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  21.13 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2214  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.91 
 
 		 363 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.422159  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 		 430 aa  43.9  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  35.9 
 
 		 320 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  23.11 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1961  lipoyl synthase  24.87 
 
 		 336 aa  43.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  28.24 
 
 		 361 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 		 367 aa  42.7  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  37.7 
 
 		 361 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  22.22 
 
 		 331 aa  42.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  23.94 
 
 		 338 aa  42.7  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>