85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1409 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  97.75 
 
 		 356 aa  708    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  88.45 
 
 		 360 aa  655    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  724    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  83.66 
 
 		 360 aa  614  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  81.06 
 
 		 359 aa  615  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  78.49 
 
 		 362 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  71.55 
 
 		 367 aa  534  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  71.27 
 
 		 367 aa  535  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  71.55 
 
 		 367 aa  535  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  68.73 
 
 		 370 aa  479  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  67.13 
 
 		 371 aa  477  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  68.55 
 
 		 323 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  59.1 
 
 		 362 aa  424  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  58.03 
 
 		 365 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  54.47 
 
 		 362 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  52.96 
 
 		 379 aa  358  6e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2060  Radical SAM domain protein  45.07 
 
 		 374 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  47.35 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  46.3 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  45.54 
 
 		 351 aa  260  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2885  Radical SAM domain protein  27.24 
 
 		 405 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806461  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0775  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 404 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2001  radical SAM domain-containing protein  28.52 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2747  hypothetical protein  30.94 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0196  hypothetical protein  26.27 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0963  hypothetical protein  25.39 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  28.95 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0270  hypothetical protein  27.35 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.901692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2140  Radical SAM domain protein  29.79 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  22.18 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  24.9 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  25.64 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  23.47 
 
 		 390 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2171  Radical SAM domain protein  22.36 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00159358  decreased coverage  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2543  radical SAM domain protein  22.36 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0844  radical SAM domain-containing protein  26.03 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  31.18 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1662  radical SAM family Fe-S protein  24.11 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  25.4 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2046  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 331 aa  57  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0033  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.531209  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  30.3 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  30.71 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  24.68 
 
 		 366 aa  54.3  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1034  radical SAM domain-containing protein  21.91 
 
 		 375 aa  53.1  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14130  radical SAM enzyme, Cfr family  28.57 
 
 		 351 aa  53.1  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1803  radical SAM family protein  25.81 
 
 		 321 aa  53.1  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  27.09 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2967  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  30.07 
 
 		 358 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0788473  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  30.47 
 
 		 377 aa  50.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6000  radical SAM domain-containing protein  22.92 
 
 		 380 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04411  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  26.98 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0592  Radical SAM domain protein  24.03 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000649486  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0962  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  26.4 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1253  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.08 
 
 		 373 aa  47.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.405878  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2804  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  28.68 
 
 		 355 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.745253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5856  radical SAM enzyme, Cfr family  27.91 
 
 		 378 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0461  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  31.91 
 
 		 364 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.745055  normal  0.162604 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2180  radical SAM protein  29.77 
 
 		 377 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28470  radical SAM enzyme, Cfr family  25.74 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.267861  hitchhiker  0.00294853 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  26.36 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  28.16 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1520  Radical SAM domain protein  24.52 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  21.4 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3129  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  23.74 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  25 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2088  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 		 351 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.6 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1380  radical SAM protein  27.78 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40320  hypothetical protein  24.22 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666991  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0912  radical SAM domain-containing protein  24.17 
 
 		 295 aa  44.7  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1727  hypothetical protein  21.72 
 
 		 421 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3610  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  28.12 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2928  radical SAM protein  25.76 
 
 		 345 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.333944  normal  0.253326 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4182  radical SAM protein  24.8 
 
 		 374 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  24.44 
 
 		 342 aa  43.5  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0681  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 		 283 aa  43.1  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2063  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  27.91 
 
 		 351 aa  43.1  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.029616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2310  radical SAM enzyme, Cfr family  23.81 
 
 		 349 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0772545  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2685  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  26.77 
 
 		 346 aa  42.7  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000061721  normal  0.591184 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.46 
 
 		 373 aa  42.7  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>