170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1662 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1662  radical SAM family Fe-S protein  100 
 
 		 327 aa  661    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  55.21 
 
 		 331 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  53.82 
 
 		 331 aa  352  5e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2046  radical SAM domain-containing protein  53.21 
 
 		 331 aa  350  2e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  46.2 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  46.6 
 
 		 322 aa  301  1e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  40.2 
 
 		 314 aa  229  7e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  37 
 
 		 343 aa  220  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  39.44 
 
 		 322 aa  218  7.999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2140  Radical SAM domain protein  39.32 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1803  radical SAM family protein  36.31 
 
 		 321 aa  202  9e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  26.48 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.9 
 
 		 362 aa  67  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  26.17 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  24.11 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  26.4 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  25.69 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.03 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  23.32 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0775  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 		 404 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  25.3 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  21.32 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  24.8 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  24.8 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  26.43 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  25.25 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2060  Radical SAM domain protein  23.71 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  22.71 
 
 		 379 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  21.94 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  29.1 
 
 		 364 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2885  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 		 405 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806461  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  23.32 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  25.7 
 
 		 320 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  28.04 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  31.85 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  21.01 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  22.78 
 
 		 367 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2001  radical SAM domain-containing protein  21.35 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  24.56 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  26.8 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  26.8 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0251  radical SAM domain-containing protein  23.48 
 
 		 372 aa  50.8  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.996674  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3934  lipoyl synthase  26.46 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521126  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  24.12 
 
 		 370 aa  50.4  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1125  Fe-S oxidoreductase  23.69 
 
 		 555 aa  49.7  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  26.51 
 
 		 376 aa  49.7  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0277  biotin synthase  27.63 
 
 		 340 aa  49.7  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.504189  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  25.73 
 
 		 331 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1520  Radical SAM domain protein  31.43 
 
 		 310 aa  49.3  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03970  biotin synthase, putative  27.04 
 
 		 388 aa  49.3  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.299072  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1433  biotin synthase  23.87 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  27.56 
 
 		 331 aa  49.3  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1117  biotin synthase  26.14 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0919  Radical SAM domain protein  25.25 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000116556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  27.19 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  27.73 
 
 		 361 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0470  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  28.9 
 
 		 438 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  28.88 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  28.21 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  28.21 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4336  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  28.81 
 
 		 449 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.17 
 
 		 359 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4276  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  28.81 
 
 		 449 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  26.73 
 
 		 361 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1869  biotin synthase  27.63 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0261437  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0705  radical SAM domain-containing protein  24.4 
 
 		 283 aa  47.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  28.72 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0899  lipoic acid synthetase  27.89 
 
 		 285 aa  47.4  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0377  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  29.94 
 
 		 450 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2322  radical SAM family Fe-S protein  27.42 
 
 		 523 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3784  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  27.89 
 
 		 368 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2844  biotin synthase  24.18 
 
 		 345 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0410  lipoyl synthase  26.29 
 
 		 326 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  25.95 
 
 		 354 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3415  biotin synthase  25.73 
 
 		 374 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371377  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  25.77 
 
 		 332 aa  47  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  23.72 
 
 		 320 aa  46.2  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1425  biotin synthase  24.18 
 
 		 345 aa  46.6  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2931  biotin synthase  24.18 
 
 		 345 aa  46.6  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  25.32 
 
 		 351 aa  46.2  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  25.26 
 
 		 327 aa  45.8  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  28.72 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0436  biotin synthase  22.66 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  25.39 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  26.92 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3733  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  29.48 
 
 		 441 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0655484 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0259  biotin synthase  22.66 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1266  biotin synthase  25 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.537106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  26.92 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  23.39 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  23.39 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0912  radical SAM domain-containing protein  24.39 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  30.43 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  26.92 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  26.29 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  26.29 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  26.29 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  26.29 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>