53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0705 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0705  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 283 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0681  radical SAM domain-containing protein  92.23 
 
 		 283 aa  545  1e-154  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0033  radical SAM domain-containing protein  47.7 
 
 		 296 aa  248  9e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.531209  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0912  radical SAM domain-containing protein  44.25 
 
 		 295 aa  244  8e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0962  radical SAM domain-containing protein  40.69 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1520  Radical SAM domain protein  39.47 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0919  Radical SAM domain protein  38.05 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000116556  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  33.08 
 
 		 266 aa  152  8e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1558  radical SAM domain-containing protein  31.18 
 
 		 355 aa  151  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0417812 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2088  Radical SAM domain protein  31.9 
 
 		 351 aa  138  8.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  29.58 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0592  Radical SAM domain protein  28.1 
 
 		 371 aa  112  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000649486  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  28.23 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2171  Radical SAM domain protein  24.11 
 
 		 378 aa  102  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00159358  decreased coverage  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2543  radical SAM domain protein  24.11 
 
 		 378 aa  102  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  24.47 
 
 		 383 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  25.18 
 
 		 390 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  25.59 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0251  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 372 aa  53.1  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.996674  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  22.17 
 
 		 345 aa  52.4  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  26.21 
 
 		 331 aa  52.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  23.81 
 
 		 364 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  27.37 
 
 		 380 aa  50.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  22.94 
 
 		 346 aa  49.7  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 		 322 aa  49.3  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2140  Radical SAM domain protein  27.48 
 
 		 323 aa  48.9  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  28.28 
 
 		 370 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0381  lipoyl synthase  26.01 
 
 		 297 aa  46.6  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.224918  hitchhiker  0.0000000000185759 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1798  Radical SAM domain protein  23.87 
 
 		 377 aa  46.6  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0702083  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  26.5 
 
 		 343 aa  46.2  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  23.67 
 
 		 331 aa  45.8  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  20.09 
 
 		 347 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1662  radical SAM family Fe-S protein  22.42 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  25.96 
 
 		 360 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  25.12 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  23.94 
 
 		 339 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0882  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  20.51 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  28.57 
 
 		 356 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000234633  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  21.91 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  24.1 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3729  radical SAM domain-containing protein  21.69 
 
 		 393 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4389  radical SAM domain-containing protein  22.61 
 
 		 393 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.484216 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  19.66 
 
 		 347 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.75 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.47 
 
 		 321 aa  43.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1032  hypothetical protein  26.28 
 
 		 348 aa  43.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 321 aa  42.7  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  22.49 
 
 		 331 aa  42.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  21.43 
 
 		 338 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  23.77 
 
 		 356 aa  42.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  21.43 
 
 		 338 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  24.44 
 
 		 352 aa  42  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  19.27 
 
 		 344 aa  42  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>