55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1221 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 356 aa  717    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  77.14 
 
 		 351 aa  534  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2060  Radical SAM domain protein  67.32 
 
 		 374 aa  482  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  65.47 
 
 		 337 aa  408  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  51.03 
 
 		 367 aa  292  5e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  49.12 
 
 		 367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  47.04 
 
 		 356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  46.75 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  50.15 
 
 		 367 aa  279  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  50.75 
 
 		 370 aa  278  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  48.09 
 
 		 371 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  44.54 
 
 		 360 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  49.15 
 
 		 323 aa  270  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  48.1 
 
 		 379 aa  269  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  39.2 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  45.4 
 
 		 359 aa  263  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  45.1 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  45.4 
 
 		 362 aa  259  7e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  43.27 
 
 		 362 aa  257  3e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  42.69 
 
 		 365 aa  250  3e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2001  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  31.77 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2046  radical SAM domain-containing protein  31.71 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  24.9 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  25.22 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0844  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1803  radical SAM family protein  25.69 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1662  radical SAM family Fe-S protein  26.4 
 
 		 327 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  22.27 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2885  Radical SAM domain protein  22.59 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806461  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0963  hypothetical protein  22.59 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0775  radical SAM domain-containing protein  22.92 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  25.1 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0196  hypothetical protein  22.76 
 
 		 401 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 		 266 aa  53.5  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2747  hypothetical protein  28.06 
 
 		 401 aa  53.1  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2140  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  32.32 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0270  hypothetical protein  22.86 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.901692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1727  hypothetical protein  23.73 
 
 		 421 aa  49.7  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0672  lipoyl synthase  26.18 
 
 		 308 aa  50.1  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.61797  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  22.27 
 
 		 322 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  27.46 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  23.81 
 
 		 341 aa  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5825  hypothetical protein  26.32 
 
 		 433 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  28.45 
 
 		 453 aa  46.2  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  23.58 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0810  lipoyl synthase  26.74 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1401  lipoyl synthase  26.18 
 
 		 300 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0781  lipoyl synthase  25.77 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2076  lipoyl synthase  39.08 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.39872  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  25.44 
 
 		 366 aa  43.9  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  24.85 
 
 		 291 aa  43.5  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>