17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5825 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5825  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  894    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2257  radical SAM family Fe-S protein  53.85 
 
 		 446 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.452543  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0844  radical SAM domain-containing protein  42.04 
 
 		 421 aa  325  8.000000000000001e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1727  hypothetical protein  27.32 
 
 		 421 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0775  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 		 404 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2885  Radical SAM domain protein  27.18 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806461  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2001  radical SAM domain-containing protein  23.04 
 
 		 377 aa  90.9  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0963  hypothetical protein  22.09 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  25.41 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2046  radical SAM domain-containing protein  23.69 
 
 		 331 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 		 351 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 356 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0270  hypothetical protein  27.5 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.901692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  27.56 
 
 		 337 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  24.21 
 
 		 331 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  20.36 
 
 		 322 aa  43.9  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  22.35 
 
 		 367 aa  43.9  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>